Ленинградский штаб партизанского движения (ЛШПД), являясь военно-боевым органом обкома партии, в то же время согласовывал свою деятельность с военными советами Ленинградского и других фронтов, находившихся на территории области. Штаб объединял усилия партийных органов и военного командования по развитию партизанского движения. С организацией Ленинградского штаба партизанского движения окончательно сложился единый орган, направлявший партизанские действия в тылу гитлеровских войск на территории Ленинградской области. Были достигнуты централизация руководства партизанской борьбой и возможность согласования действий партизан с операциями войск.
Ленинградский обком ВКП(б) и Военный совет Ленинградского фронта предложили штабу партизанского движения принять меры по улучшению связи с партизанскими отрядами, в значительной степени нарушенной вследствие наступления гитлеровских войск, начавшегося в середине августа. Выход вражеских войск к ближним подступам Ленинграда требовал активизации партизанской борьбы.
29 сентября Военный совет Ленинградского фронта (Г. К. Жуков, А. А. Жданов, А. А. Кузнецов) рассмотрел и утвердил представленный штабом партизанского движения "План организации связи и руководства партизанскими отрядами в Ленинградской области". Основная цель плана заключалась в том, чтобы действия партизанских отрядов теснее увязать с операциями Красной Армии. Для этого необходимо было не только восстановить нарушенную связь с партизанскими отрядами, но и принять ряд других мер по улучшению руководства партизанским движением в области, создавать новые отряды, обеспечивать их вооружением и боеприпасами, всем необходимым для боевой деятельности.
Осуществляя этот план, Ленинградский штаб партизанского движения направил в конце сентября большую группу связных в тыл врага: в Тосненский район - 10 человек, в Красногвардейский - 9, в Славковичский - 7, в Дновский - 5, в Карамышевский - 6, в Слуцкий - 4, а всего более 60 человек. В октябре ЛШПД передал в партизанские отряды, действовавшие в полосе 8-й армии, u радиостанций, а в полосе 54-й армии-11. Как отмечал M. H. Никитин, через рации штаб осуществлял руководство боевой деятельностью отрядов, ставил им новые боевые задачи и менял районы их действия. Партизанские отряды, имевшие радиостанции, являлись наиболее боеспособными.
Важным шагом на пути завершения создания системы руководства партизанским движением в Ленинградской области явилось учреждение представителей областного штаба (оперативных групп) при военных советах фронтов и армий.
Увеличение размаха борьбы на территории Ленинградской области, действие здесь трех крупных группировок советских войск (двух фронтов Северного и Северо-Западного, а также Волховской группы войск), образование в их составе новых армий усложняло руководство партизанской борьбой. К тому же создание в составе политуправлений фронтов и политотделов армий отделов и отделений по руководству партийно-политической работой среди населения оккупированных районов и войск Красной Армии, оказавшихся на территории, занятой врагом, повышало роль политорганов в развертывании партизанской борьбы и вместе с тем требовало усиления координации между ними и местными партийными организациями.
Между тем областной штаб партизанского движения в осажденном Ленинграде был отрезан не только от Северо-Западного фронта и Волховской группы войск, но и от некоторых армий Ленинградского фронта, а оперативные группы обкома партии в связи с перегруппировкой советских войск и созданием новых сил уже не могли полностью выполнить возложенные на них задачи.
В этой обстановке предложение Военного совета 8-й армии, действовавшей на так называемом Ораниенбаумском "пятачке", создать при военных советах небольшие оперативные группы Ленинградского штаба партизанского движения, которые взяли бы на себя координацию действий партизанских сил в полосе действующих войск, было своевременным. Это предложение в конце сентября областной штаб партизанского движения принял.
В начале октября 1941 года в городе Волхове создается оперативная группа Ленинградского штаба партизанского движения при военных советах войск Ленинградского фронта, действовавших вне блокадного кольца. Начальником этой оперативной группы был назначен инструктор обкома партии А. А. Гузеев. Образованную в декабре при Военном совете Волховского фронта оперативную группу возглавил П. Р. Шевердалкин, который ранее являлся уполномоченным обкома ВКП(б) по организации подполья в Маловишерском районе, Тогда же сформировалась еще одна фронтовая оперативная группа Ленинградского штаба партизанского движения-при Военном совете Северо-Западного фронта, в полосу которого с осени 1941 года стала перемещаться вооруженная партизанская борьба в Ленинградской области. Основой второй группы послужила оперативная группа Ленинградского обкома, созданная еще в конце июля во главе с А. Н. Шинкаревым. Руководство второй оперативной группой было поручено заместителю заведующего военным отделом обкома партии В. П. Гордину.
Созданием оперативных групп Ленинградского штаба партизанского движения при военных советах Волховского и Северо-Западного фронтов в основном завершился процесс централизации борьбы на оккупированной врагом территории и координации партизанского движения с задачами советских войск.
Таким образом, к концу 1941 года впервые в истории Великой Отечественной войны в Ленинградской области сложилась определенная система руководства партизанским движением, отвечавшая характеру борьбы против гитлеровских захватчиков: штаб партизанского движения при обкоме ВКП(б), имевший своих уполномоченных при военных советах фронтов и армий, действовавших на территории области. Достигнутая централизация руководства позволяла согласовывать усилия партизан с общими усилиями советского народа в борьбе против оккупантов.
В последующем система руководства партизанским движением, сложившаяся в Ленинградской области, была принята и в других областях и республиках, подвергшихся оккупации.
2. Нелегальные партийные органы
Ленинградский обком ВКП(б) настойчиво и целеустремленно создавал сеть нелегальных партийных органов на оккупированной врагом территории, рассматривая эту работу как важнейшее условие нарастания всенародной войны в тылу врага. На организации подпольной сети были сосредоточены лучшие партийные силы. В продолжение всего периода оккупации области обком укреплял подпольные органы, мобилизуя для этого все новых и новых коммунистов.
Основными партийными органами на захваченной врагом территории Ленинградской области призваны были стать районные подпольные комитеты партии. В отличие от многих других республик и областей в Ленинградской области не создавались особые нелегальные органы, а весь состав бюро райкомов и значительная часть партийного актива во главе с секретарями переводились на нелегальное положение. В последующем, в зависимости от конкретных условий, некоторые нелегальные райкомы партии были реорганизованы в партийные центры и тройки с кооптацией в них тех коммунистов, которые могли в сложных условиях подполья руководить борьбой.
Ленинградский обком в целях экономии сил не создавал нелегальных комсомольских органов, возложив руководство организациями ВЛКСМ на райкомы партии. Первые секретари РК ВЛКСМ, являясь членами райкомов партии, практически входили в состав руководящего нелегального партийного ядра.