В куполе церкви Спаса на Нередице было изображено Вознесение, ниже на барабане – пророки, в подпружных арках – медальоны с изображением сорока мучеников. На стенах и столбах поясами были расположены отдельные фигуры и композиции. Западная стена была занята большой картиной Страшного суда. Нижняя часть стен была покрыта орнаментальной росписью, подражавшей тем панелям из различных сортов мрамора, которыми украшались нижние части стен византийских храмов. На стенах и сводах церкви Спаса на Нередице был развернут цикл иллюстраций к тексту Евангелия.
Во второй половине XII века в Новгороде складывается новый тип храма. Вместо грандиозных, но единичных сооружений появляются небольшие по величине, но строящиеся в большом количестве. Это кубического типа постройки с почти квадратным планом, с тремя апсидами и четырьмя столбами, несущими одну главу. Изменяется и характер интерьера. Пышные открытые полати-хоры заменяются закрытыми со всех сторон угловыми камерами на сводах соединенными между собой небольшим деревянным помостом. В одной из этих камер устраивался придел, нередко посвященный патрону церкви, другая камера часто использовалась как хранилище. Внутреннее пространство становилось более целостным, менее расчлененным. Первым дошедшим до нас памятником этого типа является церковь Благовещения у деревни Аркажи, под Новгородом, выстроенная в 1179 году. Сохранилась церковь только до половины своей высоты.
Тяжелый удар, обрушившийся на русский народ, нападение монголо-татарских полчищ, был ощутим и в Новгороде. К тому же вскоре положение Новгорода стало еще более серьезным в связи с усилившейся опасностью, угрожавшей с Запада. Однако, уже в 90-х годах XIII века, после нанесения сокрушительного удара по ливонским рыцарям, положение резко изменилось. Единственный из русских городов, сохранивший полностью памятники своей прошлой культуры и не растерявший за время монголо-татарского нашествия старые культурные традиции, Новгород вступил в полосу нового расцвета своей культуры. Строительство, вновь развернувшееся в последнее десятилетие XIII века, продолжалось непрерывно вплоть до присоединения Новгорода к Москве, в конце XV века.
В качестве строителей храмов, как и в конце XII века, выступали представители крупнейших боярских фамилий, посадники, иногда корпорации купцов; много церковных, гражданских и даже военных построек вел новгородский архиепископ. Дошедший до нас памятник конца XIII века – церковь Николы на Липне, выстроенная архиепископом в 1292 году архиепископом Климентом, свидетельствует о том, что в традиционном типе храма, широко распространенном в новгородском зодчестве второй половины XII века, произошли существенные изменения.
Новгородцы отказались от старой системы посводного (по закомарам) покрытия. Новую структуру сводов отражало трехлопастное покрытие церкви Николы. Отказ от трехчастного членения на фасадах придал церкви еще большую монолитность. Зодчий церкви Николы впервые отказался от боковых абсид, одновременно опустив центральную до половины высоты храма. Отличительной чертой церкви является вытянутость пропорций, ранее не встречавшаяся в новгородских памятниках. Отмечается также некоторая роль романского зодчества, откуда новгородский зодчий черпал отдельные конструктивные детали и отдельные конструктивные элементы композиционного решения, не нарушавшие старой традиционной схемы здания в целом.
Существенной особенностью церкви Николы является новая техника кладки. Характерной чертой новгородского зодчества XIV – XV веков становится кладка на плиты. Системы чередования рядов кирпича и камня здесь уже нет. В этой технике выстроены не только все церкви Новгорода и его пригородов, но и все крепостные сооружения.
Фресковая роспись церкви Николы на Липне почти полностью скрыта под малярной записью 1877 года. Незначительные фрагменты древней стенописи, избежавшие реставрации XIX века, сохранились за иконостасом и позднее были раскрыты. Расположенная на алтарных столбах композиция Благовещения и на примыкавшем своде композиция «Три отрока в пещи огненной» характеризуют николо-липенскую роспись как памятник, являющийся промежуточным звеном, соединявшим новгородскую монументальную живопись домонгольского период с замечательным циклом росписей середины и второй половины XIV столетия.
В 1360 году новгородский посадник Семен Андреевич заложил церковь Федора Стратилата. В следующем году церковь была закончена. Церковь Федора Стратила является одной из наиболее классических памятников новгородского зодчества второй половины XIV века, одним из лучших по сохранности и представляет собой законченное художественное произведение. Наиболее существенным новшеством был внешний облик храма.
В трактовке фасадов зодчий церкви Федора Стратилата вновь вернулся к трехчастному членению лопатками в соответствии с внутренними структурными членения здания. На фасадах церкви особенно на барабане и абсиде, немало декоративных элементов. Барабан декорирован поясками треугольных впадинок, арочек и нишек. Абсида декорирована вертикальными тягами, стянутыми полуциркульными арками. Оконные проемы и северный портал имеют стрельчатые завершения, над окнами разнообразные по рисунку «бровки». Некоторые ниши на фасадах были украшены фресковыми изображениями.
Исходя в основном из старых плановых и пространственных решений и в то же время внеся в них ряд новых черт, зодчий храма придал новый характер внешнему оформлению здания, особенно в его завершении, и внес много нового в декоративном оформлении стены, не нарушая при этом конструктивной логичности фасада.
Роспись церкви, исполненная в 70-х годах XIV века, была расчищена в 1910 году, сохранилась почти на всех стенах, столбах, арках и сводах церкви. Значение ее исключительно. Стилистические особенности росписи свидетельствуют о том, что фрески эти исполнены Феофаном Греком. Впервые в росписи применен феофановский прием монохромного решения всей стенописи в красно-коричневых тонах, с полным отказом от яркой полихромии. В росписи церкви Федора Стратилата ярко выступает характерная для XIV века любовь к повествовательной тематике и глубоко эмоциональной трактовке человеческих страданий.
Очень хорошо сохранившимся образцом новгородского зодчества конца XIV века является церковь Иоанна Богослова в Радоковицах, выстроенная в 1384 году. Это исключительно стройная постройка с узкими лопатками на фасадах, подчеркивающими удлиненные пропорции здания. На южном фасаде сохранился заложенный портал с подвышением.
С последней четверти XIV века на судьбах Новгорода начали сказываться крупные перемены в жизни Русской земли, связанные с разгромом монголо-татарских орд Мамая Дмитрием Донским на Куликовом поле. Этот разгром бесповоротно предопределил последующее, быстро возраставшее усиление Москвы. Политика новгородского боярства, борющегося за свою обособленность, стала консервативной, мешавшей процессу создания русского национального государства. Во всех областях новгородской культуры, в том числе и в зодчестве, началось постепенное замирание творческого движения. Зодчие стали обращаться к образцам прошлого и старым художественным оригиналам. Так, внутри церкви Петра и Павла (1406), повторяя решение церкви Федора Стратилата, сделана каменная лестница на полати в юго-западном углу. На фасаде вновь появляются орнаментальные мотивы в виде поясков из треугольных впадинок, нишки и каменные скульптурные кресты.
В середине XV века стал широко распространенным тип миниатюрной церковки, сохраняющей, однако, старые основы композиции. Несмотря на большое сокращение размеров храмов, новгородское зодчество XV века не применяло систему бесстолпных конструкций, как это было в Пскове. В XV веке впервые появились двухэтажные храмы – храмы на подклетах, которые использовались в качестве хозяйственных складов – подвалов (церковь Симеона в Зверином монастыре и др.). На фасадах подклет ничем не выражен. Нередко в эту пору подклеты устраивались и в более древних храмах путем настилки деревянного наката.
Во второй половине XV века распространенным явлением стал нарочитый архаизм, выражавшийся в подражании старым постройкам XII века. Так, в 1455 году была заново выстроена на старых фундаментах церковь Ильи на Славне, построенная в 1198 – 1202 годах. По своим формам она копирует типичную новгородскую одноглавую церковь конца XII века.
Наряду с многочисленными церковными постройками XIV – XV века в Новгороде сохранилась интересная гражданская постройка этой же поры, названная Грановитой палатой (1433). Строитель этого большого парадного здания архиепископ Евфимий, стремясь укрепить авторитет и могущество новгородской знати, начал парадную обстройку двора в новгородском детинце. В результате многолетнего строительства двор новгородского владыки стал сложным комплексом каменных зданий.
Дошедшее до нас здание состоит из нескольких помещений, главное из которых представляет большой зал, перекрытый сводами на нервюрах, опирающихся на столб в центре зала. В отличие от Грановитой палаты Московского Кремля, построенной несколько позднее Марко Руффо в духе Возрождения, новгородская палата является запоздалым памятником готики на Руси.
Предназначалась палата для торжественных приемов и заседаний. Здесь в последний период новгородской самостоятельности заседал боярский Совет Господ, который возглавлял сам владыка.
После 1478 года бурное строительство, характерное для Новгорода, резко оборвалось. За последние двадцать лет XV века и первое десятилетие XVI века новгородские летописи отметили лишь одну постройку деревянной церкви на владычном дворе, поставленную в один день по случаю мора. Однако, к этим десятилетиям относятся два весьма крупных начинания московского правительства в области крепостного строительства. В 1484 году по указу князя Ивана Васильевича началось по старой основе строительство каменного детинца. В 1490 году работы были закончены.
После окончания реконструкции детинца черед 12 лет была произведена полная перестройка внешней линии обороны Новгорода. Вокруг всего города на земляном валу были поставлены новые деревянные стены, разбитые каменные башни заменили новыми деревянными.
Лишь с 1510 года вновь начала развертываться строительная деятельность некоторых частных лиц и объединений, особенно усилившаяся в 20-годах XVI века. В 1510 году гость московский Иван Сырков поставил каменную церковь Жён-Мироносиц, представляющую собой четырехстолпное кубического типа здание, к западной стене которого примыкает паперть. Церковь разделена на три этажа. Нижний и подвальный этажи использовались для хозяйственных целей. С трех сторон к церкви примыкали широкие галереи на столбах, соединенных между собой полуциркульными арками. Часть галерей сохранилась и поныне. Открытая галерея вокруг храма придавала церкви Жён-Мироносиц необычный для Новгорода московский облик, хотя и по своему плану и по трактовке фасадов постройка была связана со старой новгородской традицией.
В 1520 году московским гостем Василием Таракановым была выстроена церковь Климента. Тараканов был представителем крупнейшей фамилии московских гостей, переселенных в Новгород на место высланных новгородцев. Выстроенная церковь по своим формам представляет типично новгородскую четырехстолпную одноглавую постройку с восьмискатным завершением. В отличие от более старых новгородских храмов церковь Климента выстроена целиком из кирпича, что свидетельствует о том, что новые московские заказчики вынуждены были обращаться к новгородским строителям, не сразу отказавшимся от своих традиций.
В 1529 году Дмитрий Иванович Сырков, построивший церковь Жён-Мироносиц, заложил новую церковь Прокопия на своем дворе, поблизости от своей ранее построенной церкви. Церковь Прокопия, выстроенная также новгородскими зодчими, представляет уже некоторую уступку московским вкусам, о чем свидетельствуют килевидные завершения средних членений фасадов, килевидные арочки на западной невысокой пристройке, примыкающей к основному кубу храма, декор барабана, а также возврат к трем абсидам, вместо привычной для новгородского зодчества одной. Однако, несмотря на эти московские детали, в целом церковь Прокопия является памятником новгородского искусства, что сказывается и в пощипцовом восьмискатном завершении храма и в его близости к новгородским памятникам в отношении общей композиции.
В 1536 году по заказу московских и новгородских купцов была построена церковь Бориса и Глеба. Церковь выстроили на месте более древней постройки 1377 года с использованием ее фундаментов. Однако, выстроенная на старом фундаменте церковь, в основном отражала московские вкусы. При ее постройке применили московское пятиглавие. Фасады церкви завершаются килевидными арками при пощипцовом покрытии каждого членения. Кроме того, под центральной главой были применены подпружные арки, а под угловыми главами – ступенчато-перекрещивающиеся.
Более сложное переплетение новгородских и московских традиций представляет выстроенная в 1533 году в Антониевом монастыре церковь Сретения. Как внутреннее пространство, так и обработка фасадов этой церкви для новгородского зодчества необычны. Внутри церковь представляет собой бесстолпную постройку, перекрытую сферическим сводом, опирающимся в углах на тромпы. Церковь разделена на два этажа. Нижний этаж имел хозяйственное назначение. С западной стороны к церкви примыкает большое помещение трапезной с восьмигранным столбом в центре, перекрытое коробовыми сводами с распалубками.
Необычны и фасады здания. Восточный фасад аналогичен северному и западному, так как церковь не имеет абсид. Плоские лопатки образуют трехчастное членение фасадов. Совершенно изменено декоративное оформление фасадов. От московских архитектурных традиций идут и горизонтальные тяги, отрезающие килевидные завершения средних и боковых членений. Однако основное композиционное решение Сретенской церкви повторяло привычную в Новгороде форму кубического, несколько вытянутого здания с пощипцовым, восьмискатным покрытием.
Под влиянием Сретенской церкви в 1552 году была выстроена трапезная церковь Варлаама в Хутынском монастыре. Памятники новгородского зодчества XVI века отражают интересный процесс взаимодействия между новгородскими и московскими традициями. Постройки, связанные с официальными московскими правительственными заказами, сооружены на новой художественной платформе. К таким постройкам относится Преображенский собор Хутынского монастыря, выстроенный в 1515 году повелением великого князя московского Василия Ивановича. Типично московский облик имела и церковь Никиты. Церковь шестистолпного плана, была окружена галереей на открытых аркадах и у юго-восточного угла имела древний придел, над которым была сделана колокольня.
В XVII веке новгородская школа окончательно влилась в общий поток русского зодчества.