Николай Николаевич Фирсов Микробиология: словарь терминов
ПРЕДИСЛОВИЕ
Изучение студентами–биологами курсов «Микробиология», «Микробиология с основами вирусологии» связано с освоением значительного количества терминов. Наряду с традиционными обозначениями морфологии, физиологии, биохимии микроорганизмов современный словарь микробиолога постоянно расширяется за счет терминологии других разделов биологии–иммунологии, вирусологии, молекулярной биологии, экологии, биотехнологии. При довольно большом количестве биологических словарей в распоряжении студента нет доступного специализированного словаря по микробиологии. Предлагаемый словарь является попыткой создания достаточно представительного по охвату терминов справочника, который наряду с учебниками и практическими руководствами может входить в учебно–методический комплект курсов «Микробиология», «Микробиология с основами вирусологии» и др.
Лексический материал для словаря (около тысячи терминов) отобран из учебников по микробиологии разных лет издания, подготовленных для студентов университетов, а также медицинских и сельскохозяйственных вузов. Кроме этого, использовались общие и специальные словари, энциклопедии, определители, толковые словари, справочники и руководства.
Сведения по системе микроорганизмов даются в соответствии с принятой до последнего времени классификацией, представленной в «Определителе бактерий Берджи» (1997) и в 1–м издании «Руководства по систематике Берджи» (Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 1984–1989), а также с учетом 2–го издания этого руководства, первый том которого вышел в 2001 г. При отборе информации для статей автор ориентировался, как правило, на студентов, владеющих курсами ботаники, зоологии, биохимии в объеме двух первых курсов биологического факультета университета.
Все термины словаря расположены в алфавитном порядке. Для составных терминов принята алфавитно–гнездовая система, по которой большинство терминов следует искать по определяемым (ведущим) словам. Например, толкование термина «серные бактерии» следует искать в статье
БАКТЕРИИ СЕРНЫЕ.
Синонимы основного термина (выделен прописными полужирными буквами) приводятся рядом с ним (набраны прописными светлыми буквами), например–
АЗОТФИКСАЦИЯ, ДИАЗОТРОФИЯ.
Если заглавное слово повторяется в статье, то оно обозначается в тексте первой буквой с точкой.
Толкование слов, выделенных в словарной статье полужирным шрифтом, читатель найдет в соответствующем месте словаря по алфавиту. Вводимые в статьях термины даны шрифтом иной гарнитуры.
В конце словаря приводится список ученых, внесших существенный вклад в развитие микробиологии.
В приложении представлены два варианта классификации прокариот–в соответствии с «Определителем бактерий Берджи» (1997) и «Bergey's Manual of Systematic Bac–teriology» (2001. Vol. 1).
В словаре использованы сокращения наиболее часто встречающихся слов–биол. – биология, биологический; биохим. – биохимия, биохимический; лаб. – лабораторный; мед. – медицина, медицинский; микробиол. – микробиология, микробиологический; мол. – молекулярный; напр. – например; наст. – настоящее (время); пром. – промышленный; пром–ть – промышленность; уст. – устаревшее (название); физ. – физический; физиол. – физиологический. Кроме того, применяются сокращения слов, обозначающих государственную или национальную принадлежность (напр., англ. – английский, рус. – русский).
Автор выражает благодарность доктору биологических наук С. Н. Лекомцевой за участие в написании словарных статей по микологии.
А
АБИОГЕНЕЗ – 1) теория происхождения жизни путем постепенного усложнения веществ неорганической природы и возникновения биополимеров, которым присущи свойства живого и, прежде всего, способность к обмену веществ как непременному условию их существования; 2) доктрина самозарождения жизни – учение о спонтанном возникновении живых существ (напр., микроорганизмов) из неживой материи. Ее ошибочность окончательно установлена Л. Пастером.
АБИССОГИДРОТЕРМАЛЬ – см. «черные курильщики».
АБОРТИВНАЯ ИНФЕКЦИЯ – заражение вирусом клетки, которое не приводит к образованию новых вирионов. А. и. может происходить в результате лизиса клетки–хозяина вследствие избыточного подавления метаболизма клетки ранними белками вируса или обусловливаться образованием неинфекционных вирусных частиц из–за нарушения нормального цикла репродукции вируса. Иногда А. и. называют и лизогенную инфекцию.
АБСОРБЦИЯ – поглощение вещества из раствора или смеси газов твердым телом или жидкостью; в отличие от адсорбции происходит во всем объеме поглотителя.
АВТО… – первая часть сложных слов, соответствующая по значению словам «свой», «сам», «собственный».
АВТОКЛАВ – аппарат для проведения различных процессов при нагревании и под давлением выше атмосферного. В микробиол. практике применяют А. различной конструкции для стерилизации объектов высокотемпературным насыщенным водяным паром. См. также стерилизация.
АВТОЛИЗ – разрушение или саморастворение клеток за счет собственных (эндогенных) ферментов.
АВТОЛИЗАТ – продукт, получаемый в результате автолиза клеток. Напр., А. дрожжевой.
АВТОЛИЗАТ ДРОЖЖЕВОЙ – продукт, получаемый в результате автолиза прессованных пекарских дрожжей (при 60 °C в течение двух суток). Имеет сметанообразную консистенцию и коричневатый цвет. Входит в состав многих питательных сред для выращивания микроорганизмов как источник азотистых веществ и витаминов группы В.
АВТОРАДИОГРАФИЯ – метод изучения распределения радиоактивных веществ (изотопов) в исследуемом объекте или соединениях. Заключается в наложении на объект (или, напр., хроматограмму) чувствительной к радиоактивным излучениям фотоэмульсии и получении отпечатка, фиксирующего расположение радиоактивных изотопов.
АВТОТРОФЫ – организмы, способные использовать углекислоту в качестве единственного или главного источника углерода и обладающие системой ферментов для ее ассимиляции, а также способные синтезировать все компоненты клетки. Некоторые А. могут нуждаться в экзогенных (поступающих извне) витаминах и факторах роста (ауксотрофы). В зависимости от источника энергии, используемого А. для восстановления СО2, различают фотоавтотрофы (наземные зеленые растения; водоросли; цианобактерии, способные к оксигенному фотосинтезу; фототрофные бактерии, осуществляющие аноксигенный фотосинтез) и хемоавтотрофы, получающие энергию за счет окисления неорганических соединений и осуществляющие хемосинтез. Большинство А. ассимилируют углекислоту через восстановительный пентозофосфатный путь (цикл Кальвина). А. – продуценты органического вещества в биосфере, образующие первый трофический уровень в сообществах.
АВТОХТОНЫ – растительные или животные организмы, образовавшиеся в процессе эволюции в данной местности или исстари в ней обитавшие и живущие в настоящее время (иначе аборигены). См. также микробиота автохтонная.
АГАР, АГАР–АГАР – смесь полисахаридов сложного состава (агароза, агаропектин), добываемая из некоторых морских водорослей, напр. анфельции. При растворении в горячей воде образует гель. Используется как отвердитель микробиол. сред. Среды, содержащие 1,5–2,0 % А., плавятся при 100 °C и затвердевают при 45 °C. А. не расщепляется большинством микроорганизмов и не изменяет питательную ценность сред. Последние нередко называют соответствующим агаром–молочный А., картофельный А., яичный А. и др. В микробиол. целях впервые применен Ф. – А. Хессе – сотрудником Р. Коха – в 1883 г. См. также среда твердая.
АГАРОЗА – главная фракция агара, представляющая собой линейный полисахарид, построенный из строго чередующихся остатков галактопиранозы. Используется как гелевая среда в хроматографии и электрофорезе.
АГАРОПЕКТИН – полисахарид, сходный с агарозой, но содержащий уроновые кислоты и сульфат. Компонент агара.
АГГЛЮТИНАЦИЯ – явление слипания клеток микроорганизмов в жидкой культуре с образованием комков, хлопьев под воздействием специфичных для них антител агглютининов (иммуноглобулинов классов G и М), входящих в состав сывороток.
АГГЛЮТИНИНЫ – см. агглютинация.
АГРЕССИНЫ – вещества капсул микроорганизмов полисахаридной или белковой природы, взаимодействующие с защитными факторами организма хозяина и резко усиливающие вирулентность микроорганизма. Вырабатываются микробной клеткой в организме хозяина или на специальных средах. Обнаруживаются в культуральной жидкости. Токсичностью не обладают, но снижают эффективность захвата и переваривания микроорганизмов фагоцитами. Обладают антигенными свойствами (К–ан–тигены). См. антигены бактериальные.
АГМАТИН – первичный амин (амин биогенный), продукт декарбоксилирования аргинина, образующийся в процессе разложения белков микроорганизмами:
Один из трупных ядов, птомаинов (уст.).
АГРЕГАЦИЯ – образование комков, хлопьев из слипшихся клеток при культивировании микроорганизмов (чаще всего грибов) в жидкой среде. См. флоккуляция.
АГРОБАКТЕРИИ (Agrobacterium) – род аэробных, обычно почвенных, бактерий, обитающих в ризосфере. Способны вызывать образование корончатых галлов у двудольных растений. Патогенность А. обусловлена наличием у них Ti–плазмиды, индуцирующей опухоли растений и синтез клетками опухоли необычных аминокислот – опинов, которые А. используют в качестве источников азота. Особенностью Ti–плазмиды является то, что ее ДНК (Т–ДНК) встраивается в хромосомы клетки хозяина. На этом основании в генетической инженерии Ti–плазмиду Agrobacterium tumefaciens используют в качестве вектора для введения чужеродных генов в клетки растений.
АДАПТАЦИЯ – сложные физиол. и биохим. процессы, обеспечивающие приспособление организма к условиям внешней среды (или отдельным ее факторам–рН, температуре и др.).
АДЕНОВИРУСЫ – одно из семейств ДНК–содержащих вирусов (Adenoviridae), впервые выделенных из аденоидов и миндалин детей. Вирусы этого семейства имеют кубический тип симметрии, 252 капсомера и по меньшей мере 10 структурных белков. У людей вызывают ангины, конъюнктивиты, респираторные и др. заболевания. Известны А. животных.
АДСОРБЦИЯ – поглощение вещества из раствора или газа поверхностным слоем жидкости или твердого тела (адсорбентом); играет важную роль в биол. системах, широко применяется в биохимии для разделения и очистки веществ.
АДСОРБЦИЯ ВИРУСА – первая фаза взаимодействия вируса с клеткой. Характеризуется выраженной специфичностью, определяемой соответствием рецепторов клеточной стенки (находятся в липопротеиновом или липополисахаридном слое) и поверхностных структур вириона.
АЗОЛЛА (Azolla) – водный папоротник тропических и субтропических областей. Образует симбиоз с азотфиксирующей цианобактерией Anabaena azollae. Биомасса А. используется в качестве зеленого удобрения на рисовых полях.
АЗОТОБАКТЕР (Azotobacter) – род аэробных свободноживущих азотфиксирующих бактерий. Форма клеток овальная или кокковидная, подвижные и неподвижные, грамотрицательные, спор не образуют. Обычны на хороших почвах, продуценты ряда витаминов, ауксинов, антибиотиков, что объясняет их положительное влияние на рост растений. В активном состоянии связывают до 20 мг азота на 1 г использованного углевода. Некоторые виды применяются в производстве бактериального удобрения азотобактерина.
АЗОТОБАКТЕРИН – почвоудобрительный препарат, представляющий собой живую культуру свободноживущих азотфиксирующих бактерий Azotobacter chroococcum, смешанную со стерильным носителем (песком, торфом идр.). Вносится в почву вместе с семенами. Рассматривается как аналог азотных удобрений.
АЗОТФИКСАЦИЯ, ДИАЗОТРОФЙЯ – усвоение молекулярного азота воздуха азотфиксирующими прокариотными организмами с образованием соединений азота, доступных для использования др. организмами. Осуществляется как свободноживущими азотфиксирующими бактериями (клостридии, фототрофные бактерии, азоспириллы идр.), так и симбиотическими, напр. клубеньковыми бактериями. А. происходит с участием полиферментной системы нитрогеназы, которая катализирует восстановление молекулярного азота до аммиака в присутствии АТФ и восстановителя. Симбиотические азотфиксирующие организмы могут связывать в год до 200 кг азота на 1 га, свободноживущие – 15–30 кг.
АКИНЕТЫ – особые клетки цианобактерий с утолщенной оболочкой, относительно крупных размеров, с большим количеством запасных веществ (гликогена, липидов, цианофицина), пигментов (каротиноидов); образуются из вегетативных клеток и служат для переживания неблагоприятных условий и размножения.
АКРИДИНОВЫЙ ОРАНЖЕВЫЙ – диметиламиноакридин гидрохлорид–1) краситель, используемый для окрашивания нуклеиновых кислот; 2) мутаген, приводящий к элиминации плазмидных ДНК.
АКСЕНИЧНАЯ ЖИЗНЬ – экспериментальное выращивание животных (насекомых, цыплят, грызунов, собак, обезьян), лишенных микроорганизмов. См. также гнотобиоты.
АКСЕНИЧНАЯ КУЛЬТУРА – см. культура аксеничная.
АКСИАЛЬНЫЕ ФИБРИЛЛЫ – см. фибриллы аксиальные.
АКСОНЕМА – цилиндрическая структура жгутика у простейших. Обычно состоит из 9 пар белковых микротрубочек, связанных между собой. В центре А. располагается еще пара микротрубочек (реже 1 или 3), что определяет структуру жгутика 9 + 2.
АКСОСТИЛЬ – совокупность аксиальных фибрилл у спирохет.
АКТИВНЫЙ ИЛ – см. ил активный.
АКТИВНЫЙ ТРАНСПОРТ – см. транспорт активный.
АКТИВНЫЙ ЦЕНТР – см. центр активный.
АКТИНОМИКОЗЫ – инфекционные хронические заболевания человека и животных, вызываемые актиномицетами (Actinomyces israeli, A. bovis).
АКТИНОМИЦЕТЫ – крупная группа грамположительных бактерий, объединяемых в актиномицетную линию, или актинобактерии. К А. относят нокардии, актиномицеты с многоклеточными спорангиями (роды Geoder–matophilus, Dermatophilus, Frankia), актинопланы, стрептомицеты, мадуромицеты, термоактиномицеты, способные к умеренной термофилии, и др. Филогенетически к А. близки коринеформные бактерии и микобактерии. Тривиальное название А. укоренилось за бактериями, образующими подобие мицелия, наиболее известными из которых являются нокардии и стрептомицеты. Уст. название А. – «лучистые грибки». В большинстве своем А. – обитатели почвы, почти все – аэробы, органотрофы, могут разлагать самые различные природные полимеры, в частности хитин, многие способны к активному антагонизму за счет синтеза антибиотиков. Последнее в значительной степени стимулировало изучение этой группы микроорганизмов в интересах биотехнологии.
АКТИНОМИЦИНЫ – антибиотики полипептидной природы, продуцируемые актиномицетами; подавляют синтез нуклеиновых кислот.
АКТИНОФАГИ – вирусы, поражающие актиномицеты. Наносят существенный ущерб при пром. получении антибиотиков.
АКЦЕПТОР ЭЛЕКТРОНОВ, АКЦЕПТОР ВОДОРОДА – соеднение, принимающее электроны (водород) в процессе окислительно–восстановительных реакций. В качестве конечного (терминального) А. э. микроорганизмы способны использовать кислород (аэробы), а также органические соединения, углекислоту, сульфат–и нитрат–ионы и др. (анаэробы).
АЛИКВОТА – небольшое количество вещества в растворе точно известного объема.
АЛКАЛОФИЛЫ – микроорганизмы, развивающиеся в щелочных средах (рН 9,0—11,0). Облигатные А. растут в пределах рН 8,5—11,0; факультативные – 5,0—11,0. К А. относятся, напр., аммонифицирующие бактерии. В основном почвенные и водные организмы. То же, что и базофилы, базофильные организмы.
АЛЛЕРГЕН – вещество, вызывающее аллергию, в широком смысле слова – обладающее антигенными свойствами.
АЛЛЕРГИЯ – повышенная реактивность иммунной системы организма к повторным воздействиям на него различных аллергенов (микроорганизмов, чужеродных белков ит. д.). Широко распространена у человека, известна у птиц и млекопитающих. При А. организм отвечает на специфический аллерген чрезмерной реакцией, повреждающей его собственные клетки и ткани в результате отека и воспаления, спазма и расслабления гладкой мускулатуры. А. рассматривают как патологическое нарушение иммунитета. См. также анафилаксия.