Пандемия не новое понятие и явление. К сожалению, периодически это происходит.
В определенный момент вирусы мутируют и приобретают новые свойства, которые делают их опасными для человека. Это происходит в процессе спилловера (англ. spillover). Так произошло с вирусом SARS-CoV и МЕRS-CoV, когда коронавирусы после длительного контакта с животными, которые являются их природным резервуаром, мутировали и стали опасными для человека (Рисунок 1). Если вы посмотрите на этот рисунок, вы увидите, что после SARS-CoV-2 есть еще одна стрелка и знак вопроса. Дело в том, что пандемия COVID-19 не последняя. Для этих явлений характерна цикличность, и мы пока не знаем, какой вирус и когда мутирует и спровоцирует новую опасную вспышку.
Подобное периодически происходит и с вирусом гриппа. Существует 4 типа вирусов сезонного гриппа типы A, B, C и D. Вирусы гриппа A и B циркулируют чаще и вызывают сезонные эпидемии болезни. Вирусы гриппа А подразделяются на подтипы в соответствии с комбинациями гемагглютинина (HA) и нейраминидазы (NA), гликопротеинов (белков) на поверхности вируса. Среди вирусов гриппа типа А существует 13 различных гемагглютининов и 9 нейраминидаз, которые периодически могут обмениваться местами.
Гемагглютинин ответственный за прикрепление вируса к клеткам-хозяевам. Есть примерно 1000 тримеров («шипов») гемагглютинина на один вирион гриппа. Тример гемагглютинина связывается с группами сиаловой кислоты на гликопротеинах и гликолипидах клетки-хозяина. Предполагается, что нейраминидаза разрушает рецепторы к вирусу, и помогает вирусным частицам проникать через секреты слизистых, богатых сиаловой кислотой, для достижения вирионами клеток-мишеней эпителия дыхательных путей. Однако, роль фермента не ясна до конца.
Согласно номенклатуре Всемирной организации здравоохранения, каждый штамм вируса определяется своим животным-хозяином происхождения (указывается, если это не человек), географическим происхождением, номером штамма, годом выделения и антигенным описанием HA и NA. Например, A/Sw/Iowa/15/30 (H1N1) обозначает изолят штамма A 15, который возник у свиней в штате Айова в 1930 году и имеет антигенные подтипы 1 HA и 1 NA. [8]
Вирус гриппа способен мутировать, и мутирует он достаточно часто. Резервуаром вируса гриппа могут быть свиньи, утки, куры и другие птицы. У многих есть фермы, и не секрет, что там все эти животные пересекаются. Обмениваются вирусом. Вирус приобретает новые свойства, переходит от одного вида животного к другому, от животного к человеку, от человека к животным и т. д. Отличительной особенностью вируса гриппа является его изменчивость. Вирус может настолько полностью изменять свои поверхностные антигены, что иммунный ответ на инфекцию вирусом, вызвавшим предыдущую эпидемию, практически не защищает от вируса, вызывающего последующую эпидемию. Антигенная изменчивость обусловлена, главным образом, изменениями в шипах гемагглютинина и нейраминидазы, выступающих из вирусной оболочки. Два разных механизма генерируют антигенную вариацию в HA и NA: антигенный дрейф и антигенный шифт.
Антигенный дрейф включает ряд спонтанных точечных мутаций, которые происходят постепенно, что приводит к незначительным изменениям в HA и NA. Антигенный шифт приводит к внезапному появлению нового подтипа гриппа, который значительно отличается от вируса, присутствовавшего в предыдущей эпидемии. [8] Появление нового подтипа вируса приводит к новой эпидемии, так как у людей нет иммунитета от нового штамма, появляется необходимость создания новой вакцины.
Впервые вирус человеческого гриппа был выделен в 1934 году; этот вирус получил обозначение подтипа H0N1 (A/Puerto Rico/8/34). Подтип H0N1 сохранялся до 1947 года, когда антигенный шифт породил новый подтип, H1N1 (A/Fort Monmouth/1/47), который вытеснил предыдущий подтип и стал распространенным во всем мире до 1957 года, когда появился H2N2 (A/Singapore/1/57). Подтип H2N2 преобладал в течение следующего десятилетия и был заменен в 1968 году на H3N2 (A/Hong Kong/1/68). Антигенный шифт в 1977 году ознаменовался повторным появлением H1N1 (A/USSR/80/77). Последний антигенный шифт, произошедший в 1989 году, привел к повторному появлению H3N2 (A/Shanghai/16/89), который оставался доминирующим в течении следующих нескольких лет. Тем не менее, штамм H1N1 вновь появился в Техасе в 1995 году (A/Texas/36/95). [8] В этом же году регистрировались штаммы A/Wuhan/359/95 H3N2 и A/Johannesburg/33/95 H3N2. В 1997 г. A/Hong Kong/156/97 H5N1, в 1999 A/Moscow/10/99 (H3N2) и A/New Caledonia/120/99 (H1N1), в 2001 году B/Hong Kong/330/2001. С 2005 до 2012 года спорадические вспышки возникали во Вьетнаме, Индонезии, Ираке, Турции, Таиланде, Китае и других странах (A/H5N1, A/H7N2). Как мы знаем, в 2009 году произошла новая пандемия гриппа А (A/California/7/2009 (H1N1) pdm09) (Рисунок 1). Инфицирование людей вирусом птичьего гриппа A (H7N9) и A (H5N6) в Китае происходило в 20132017 гг. Возможно, вы не знали, но известная «испанка» в 19181920 гг., унесшая жизни от 17 млн до 50100 млн человек, также была спровоцирована вирусом гриппа H1N1. Это удалось узнать после эксгумации тел погибших и анализа их легких. Это была, скорее всего, самая крупная пандемия за всю историю человечества. Представьте, если бы тогда могли диагностировать вирусные инфекции и создавать вакцины сколько жизней можно было бы спасти.
В настоящее время среди людей циркулируют вирусы гриппа подтипов A (H1N1), A (H3N2) и небольшое число вирусов гриппа В.
Больше о вспышках гриппа можно найти по ссылке: https://www.who.int/csr/don/archive/disease/influenza/ru.
Пандемия COVID-19
В том, что вирус SARS-CoV-2 не был создан в лаборатории и имеет природное происхождение нет сомнений. Не было обнаружено никаких признаков того, что вирус создан в лаборатории. [9] Резервуар вируса летучие мыши (Rhinolophus sinicus). [10]
Оригинальная статья о происхождении вируса доступна по ссылке: https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9.
У нас сейчас есть такая штука, как GenBank база данных, находящаяся в открытом доступе, содержащая все аннотированные последовательности ДНК и РНК, а также последовательности закодированных в них белков. Если бы при создании коронавируса SARS-CoV-2 использовался генетический материал известных человеку коронавирусов, исследователи бы обнаружили это при его изучении.
Рисунок 2. Геномная эпидемиология коронавируса SARS-CoV-2.
По состоянию на 10:00 CET 22 июня 2020 года в мире зафиксировано 8 860 331 подтверждённых случаев COVID-19, погибли 465 740 человек. Из них в Италии 238 499 случаев, 34 634 погибших; Россия 592 280 заболевших, 8 206 погибших; Украина 37241 заболевших, 1012 погибших. [11] Ситуация в других странах (17 июня): Китай 84867 заболевших, 4645 погибших; Корея 12198 заболевших, 279 погибших; Австралия 7347 заболевших, 102 погибших; Испания 244328 заболевших, 27136 погибших; Германия 187184 заболевших, 8830 погибших; Франция 153045 заболевших, 29481 погибших; Великобритания 298140 заболевших, 41969 погибших; Иран 192439 заболевших, 9065 погибших; США 2 098106 заболевших, 115980 погибших; Бразилия 888271 заболевших, 43959 погибших; Канада 99147 заболевших, 8175 погибших. Пандемия распространилась на более чем 200 стран и территорий; потребовалось более трех месяцев, чтобы достичь первых 100 000 подтверждённых случаев, и всего 12 дней, чтобы достичь следующих 100 000. 30 января Всемирная организация здравоохранения объявила эту вспышку чрезвычайной ситуацией в области общественного здравоохранения, имеющей международное значение. 11 марта 2020 г. ВОЗ определила вспышку как пандемию.
Соотношение подтвержденных случаев по полу (М:Ж) составляет 1,03: 1. Для мужчин средний возраст составляет 52 года (IQR 3765), а для женщин 50 лет (IQR 3564). [12]
R0 (индекс репродукции, reproductive number) = 22,5 [13], по некоторым данным 5,7 [14]. Индекс репродукции это количество здоровых человек, которым больной может передать вирус. R0 SARS-CoV-2 растет с увеличением числа подтвержденных случаев, и до настоящего времени он превысил R0 MERS (R0 = 0,6) и SARS (R0 = 1). [15]
Смертность: около 0,66% в Китае, 2,7% вне Китая [15].
Информация о том, что вирус SARS-CoV-2 похож на вирус ВИЧ ложная. SARS-CoV-2 и ВИЧ 2 абсолютно разных вируса. Применение антиретровирусных препаратов для лечения COVID-19 не означает, что это одинаковые заболевания. С учетом отсутствия одобренных для лечения COVID препаратов, врачи в Китае и в других странах пробовали лечить инфекцию имеющимися доступными противовирусными препаратами.
Для тех, кто сомневается в существовании коронавируса история медицинского работника из Италии во время пандемии.
Пациент умирает. В хаосе отделения, которое перевернуто с ног на голову, уходит душа, и никто даже не осознает этого. Даже сосед по палате, потому что он тоже болен. Он уходит под звуки устройств, которые звонят и под звуки проходящих перед палатой людей, у которых нет времени остановиться Тогда вы только на мгновение входите в палату и видите этого пациента с зеленым лицом и красными пятнами на конечностях. Он умер. Но мы знали, что это произойдет. У вас даже нет времени помолиться, потому что нужно подготовить постель для нового пациента. Я чувствую, что нахожусь за кассой и передаю продукты, подается звуковой сигнал, система забирает их и переходит к следующему продукту. Мы становимся нечувствительными машинами Мы с коллегой готовим еще одно тело. Мы моем его, закрываем глаза, накрываем. Куда мы идем дальше? В палаты, где остались другие тела. Сумки с личными вещами оставлены возле стен. У меня дрожь по коже. Я оставляю колокольчик в его руке. Никогда не знаешь, проснется ли он, возвратится к жизни. Хотя давайте посмотрим правде в глаза: этот колокольчик зазвонит только у ворот рая, где, возможно, нет места даже для невинного человека.
Инфекционные заболевания по прежнему являются причиной очень высокой смертности в мире (Рисунок 3).