Монастырь закрыли в 1923 году, позже в помещениях расположилась военная биологическая лаборатория (с 1933 года). В ней работали заключенные специалисты, которые разрабатывали биологическое оружие.
В 1934 году лабораторию передали биохимическому институту РККА.
Именно в помещениях Покровского монастыря в Суздале создали первую в мире жидкую вакцину против туляремии. Ее разработали заключенные Николай Гайский и Борис Эльберт в 1935 году.
В 1936 году лабораторию закрыли, неизвестно что в нем находилось во время Великой Отечественной Войны.
С 1950 года велись реставрационные работы (обратите внимание, А. Д. Варганов проводил реставрационные работы именно в 1934 году. Фактически он участвовал в подготовке монастыря для передачи под лабораторию), в 60-х годах в зданиях монастыря открыли музейные экспозиции. Избы-кельи построили на территории монастыря в 70-х годах двадцатого века.
В 80-х годах в монастыре разместили туристическо-гостиничный комплекс с рестораном и баром, в соборе разместили концертный зал.
В 1992 году в обители возродилась монашеская жизнь.
Архитектурный ансамбль монастыря состоит из семи построек:
Покровский собор
Большинство храмов и соборов Суздаля пятиглавые. Покровский собор увенчан тремя куполами, символизирует Святую Троицу. Его возвели на месте деревянного храма, строительство велось в период с 1510 года по 1518 год. Его можно с полной уверенностью назвать долгостроем.
Собор неоднократно восстанавливали и реставрировали, первоначальный вид воссоздан в 1962 году.
В 16 веке пол собора вымостили черной керамической плиткой, стены внутри храма выкрасили в белый цвет. Стены не должны были отвлекать внимание от икон и произведений художественного шитья, которые служили украшением храма.
Архитектурные особенности: массивное четырёхстолпное здание, возведено на высоком цоколе, с трёх сторон есть открытые галереи, две лестницы к галереям. Со стороны реки примыкает трёхапсидная алтарная часть с высокими окнами в глубоких нишах.
Декоративные элементы: гладкие колонны разделяют апсиды, украшены резными карнизами, главки в виде шлемов (символизируют шлем спасения о котором говорил апостол Павел). Стены украшены аркатурно-колончатым поясом, перспективными порталами (оформление входа) с дыньками (утолщения в форме шара или дыни), разделены лопатками (выступы разной толщины) на три части, килевидными закомарами (вид свода).
Шатровая колокольня
Возвели в 1515 году, в 17 веке колокольню надстроили. Она связана с Покровским собором крытой галереей.
Архитектурные особенности: столпообразная колокольня, изначально имела форму восьмерика (восьмигранное здание, фактически имеет восемь углов) и была увенчана главкой. В конце 17 века надстроили арочный ярус и шатёр.
Декоративные элементы: колокольня украшена тремя рядами слуховых окон, двумя арочными проёмами с рустом (облицовка неотесанными камнями, либо грубо отёсанными, либо частично), окошками с наличниками (накладная планка) и пилястрами (плоский вертикальный выступ).
Святые ворота с Благовещенской надвратной церковью
Один из самых древних памятников архитектуры в ансамбле монастыря. Возвели в 1515 году, ворота расположены в мощной башне, которую объединили с надвратной церковью. Здание часть ограды монастыря, оно неоднократно перестраивалось. Первоначальный вид вернули в 1958 году при выполнении реставрации по проекту А. Д. Варганова.
Архитектурные особенности: башня с воротами выполнена в виде четверика, она служит основанием трёхглавой церкви с маленькими пределами по углам.
Декоративные элементы: церковь украшена двумя арочными проёмами, световыми барабанами с узкими окнами, два яруса килевидных закомар, декоративные элементы напоминающие резьбу по дереву.
Трапезная палата с Зачатьевской церковью
Здание возвели в 1551 году, оно двухэтажное. Состоит из трапезной палаты и маленькой Зачатьевской церкви. Подобные строения не характерны для русского зодчества, они напоминают архитектурные стили, распространенные в католических странах. Церковь увенчана небольшой главкой.
С западной стороны к зданию пристроили часовую звонницу.
Архитектурные особенности: первый этаж предназначен для вспомогательных хозяйственных помещений. На втором этаже расположен трапезный зал с мощными сводами, которые поддерживает мощный столб, размещенный в центре зала. Звонница шестигранная с шатром на арочном ярусе.
Декоративные элементы: орнамент из красного кирпича в виде ромбов по всему периметру здания. Звонница украшена рядом слуховых окон.
Трапезная палата и Зачатьевская церковь справа
Ограда с башнями
Ограду с башнями возвели в 16 веке, но в первоначальном виде она не сохранилась. Стены вокруг монастыря неоднократно перестраивали и восстанавливали, в 20 веке отреставрировали.