Даже проспективные исследования, такие как ENIGI, имеют ограничения, и Т'Шоен признает, что результаты исследования не будут окончательным словом в отношении безопасности и эффективности лечения. Во-первых, выборка почти полностью белая, и все участники выросли в Европе. Их опыт может отличаться от опыта трансгендеров с другим прошлым или тех, кто живет в странах с более ограниченным отношением. Выборка также включает только людей, обращающихся за официальной медицинской помощью, что часто исключает людей, работающих в секс индустрии и людей, покупающих гормоны на черном рынке. И у исследователей пока нет исследования людей, которые не идентифицируют себя ни с мужчинами, ни с женщинами.