«Красная книга Российской Федерации» вышла в свет в 2001 году. Она представляет собой 860 страниц текста, иллюстрирована цветными изображениями всех занесенных в неё животных и картами их ареалов. Всего в Красную книгу Российской Федерации занесено 8 таксонов земноводных, 21 таксон пресмыкающихся, 128 таксонов птиц и 74 таксона млекопитающих, всего вместе с беспозвоночными животными 434 таксона.
В октябре 2019 года Минприроды скорректировало состав комиссии по редким и находящимся под угрозой исчезновения животным, растениям и грибам; из 44 её членов осталось лишь 20 учёных. Остальными членами стали сотрудники Минприроды и подведомственных учреждений, а также региональных охотничьих департаментов. Учёные и экологи продолжают опасаться, что спорные виды, включения которых в Красную книгу они добиваются, в неё не войдут.
В апреле 2020 года «Красная книга Российской Федерации» обновлена. В частности, в неё дополнительно включены 14 видов млекопитающих и 29 видов птиц.
Со второй половины 1980 годов в СССР началось составление региональных книг о редких видах животных и растений в масштабах республик, краёв, областей, автономных округов. Это было вызвано необходимостью немедленной охраны ряда видов и форм животных и растений, возможно, не редких в стране, но редких в отдельных регионах, а также быстро растущей в эти годы самостоятельностью местных властей и желанием самостоятельно решать свои природоохранные проблемы. Таким региональным книгам о редких животных было целесообразно придать статус региональных Красных книг. Это укрепило их правовой статус и усилило практическое воздействие на общество. Особое значение это имело для национальных автономий.
По существу, не региональная «Красная книга» на Земле одна: это «Красная книга МСОП» единственная, которая даёт информацию о редких видах в пределах всего ареала. Лишь в этом случае речь идёт о планетарном сохранении редких видов. Все остальные национальные «Красные книги» региональные, только территориальные масштабы их различны. Например, в «Красной книге СССР» (сейчас это Россия, страны СНГ и Балтии) из 80 видов птиц менее 20 внесены в книгу МСОП, а остальные являются, таким образом, редкими на местах.