14 августа 1947 года было официально объявлено об образовании Пакистана, а на следующий день, 15 августа, была провозглашена независимость Индии (или Индийского Союза). Так Британская Индия была разделена по религиозному принципу на основании все той же «теории двух наций». Ни национальный состав, ни экономические связи, ни даже административное деление, созданное самими англичанами, при демаркации границ не принимались во внимание. В результате Пакистан был образован из двух территориально разобщенных частей Западного и Восточного Пакистана, отдаленных друг от друга на 1600 километров.
Оба новых государства получили статус британских доминионов, которые приравнивались в правах к уже существовавшим «белым» доминионам Австралии, Канаде, Новой Зеландии и другим. Первоначально в законопроекте о независимости британский парламент предполагал назначить одного генерал-губернатора для обоих доминионов. Неру считал это приемлемым ради сохранения связей между разделяемыми частями страны и поддерживал кандидатуру Маунтбэттена на время переходного периода. Джинна сначала предлагал назначить сразу троих генерал-губернаторов, и чтобы Маунтбэттен стал верховным арбитром по разделу имущества между доминионами, однако кабинет Эттли отверг этот проект как слишком дорогостоящий. Но вдруг 2 июля 1947 г. Джинна заявил Маунтбэттену, что сам собирается стать генерал-губернатором Пакистана, а вице-королю предлагает роль арбитра. Британский премьер Клемент Эттли и лидер консервативной оппозиции Уинстон Черчилль поддержали это решение. Руководство Индийского национального конгресса предложило на пост генерал-губернатора Индии Маунтбэттена. 4 августа назначения были одобрены королем. Мусульмане восторженно отнеслись к назначению Джинны, индусы с замешательством к назначению Маунтбэттена.
«Теория двух наций» восторжествовала, однако раздел не решил религиозно-общинной проблемы, а лишь обострил ее. Столкновения между индусами, сикхами и мусульманами вспыхнули с новой силой. Раздел Бенгалии сразу вызвал огромный поток беженцев и переселенцев, число которых составило 12 миллионов человек. Столкновения были неизбежны, на огромных пространствах царствовал террор, религиозные фанатики по-настоящему охотились на людей другой веры. К сентябрю столкновения охватили пенджабские районы и города Лахор, Сиалкот, Амритсар, затем Дели, распространились по Бенгалии, включая Калькутту. В результате религиозно-общинных столкновений погибло не менее 500 тысяч человек. Индусы и сикхи массами переселялись в Индию, мусульмане в Пакистан. Число беженцев определяется по-разному: по официальным данным в Индию переселилось около 5 млн. индусов и сикхов из Западного Пакистана, 4 миллионов индусов из Восточного; число беженцев-мусульман определяется в 6,7 миллионов человек. Таким образом, первым и непосредственным результатом предоставления Индии независимости и раздела ее британским правительством стала резня. Погромы, массовые переселения и другие последствия раздела определили развитие Индии на несколько лет после завоевания независимости
Важной частью процесса передачи власти стал раздел вооруженных сил. Для его проведения 11 августа 1947 года был создан так называемый Объединенный Совет обороны во главе с Маунтбэттеном, в который вошли министры обороны Индии и Пакистана, а также бывший главнокомандующий старой Индийской армии, фельдмаршал Клод Окинлек, который с 15 августа должен был стать Верховным главнокомандующим в Индии и Пакистане. Полномочия Объединенного Совета по обороне должны были оставаться в силе до 1 апреля 1948 года, а полномочия Окинлека как верховного главнокомандующего до 1 декабря 1947 года. Объединенный Совет обороны должен был осуществлять контроль над разделом и реорганизацией индийских войск как двух отдельных армий доминионов. Кроме того, под его контролем находились «любые вооруженные силы, которые могут быть введены в действие под объединенным командованием на территориях близ границ между двумя доминионами, которые, согласно законодательству этих провинций, будут объявлены районами беспорядков»11. Согласно одному из параграфов «Билля о независимости», исполнительные власти обоих доминионов обязаны были выполнять любые законы и приказы, отданные Объединенным советом обороны. Однако когда разгорелся индийско-пакистанский конфликт в Кашмире, Объединенный совет не выполнил ни одной из своих обязанностей.
На совещании с индийскими лидерами, вице-король предложил им выбрать религиозный или территориальный принцип раздела армии. Джинна поддержал президента ИНК Крипалани, призвавшего ориентироваться на принцип национальности, и добавил, что его цель Пакистан, где не обращают внимания на различия в вере (!). В итоге было решено провести раздел на основе гражданства, зависевшего от географического фактора, но при этом была сделана оговорка, что с 15 августа армия Пакистана будет формироваться преимущественно из мусульман, а армия Индии из немусульман. К Индии отошли 12 танковых и моторизованных полков (бывших кавалерийских), 11 пехотных (не считая гуркхских полков, которые были разделены между Индией и Великобританией), 10 артиллерийских полков, 61 инженерная часть (в размере рот и взводов), а также 8 эскадрилий ВВС. Пакистан получил 6 танковых и моторизованных полков, 8 пехотных, 5 артиллерийских полков, 34 инженерных части и всего 2 авиационных эскадрильи. Многие полки и батальоны старой Индийской армии, имевшие «смешанный» состав, также были разделены. Отдельные батальоны и роты, сформированные из индусов и сикхов, отошли к Индии, а подразделения, сформированные из мусульман, были переданы Пакистану. Раздел вооруженных сил бывшей Британской Индии закончился к 14 августа 1947 г., и они перешли под контроль правительств Индии и Пакистана.