В стране вскоре начнётся новый виток развития медицинской науки. Увеличилось количество анатомических школ, ставшие ведущими в своей отрасли: в Москве появляется школа Д. Н. Зернова (18341917), в Киеве школа В. А. Беца (18341894), в Петербурге П. Ф. Лесгафта (18381909) основоположника теоретической анатомии и создателя отечественной науки о физическом воспитании. Мировую известность получила русская школа эмбриологии. Работавшие в России Каспар Фридрих Вольф (17331794) и Карл Бэр (17921876) заложили основы сравнительной эмбриологии позвоночных. Далее честь и слава основания этого направления как науки принадлежит нашим соотечественникам Александру Онуфриевичу Ковалевскому (18401901) и Илье Ильичу Мечникову (18451916), ставшему в 1908 году даже Нобелевским лауреатом! Эмбриология стала одной из важнейших дисциплин в нашей стране она имеет важное практическое значение для профилактической медицины и борьбы с наследственными заболеваниями.
Выдающееся место в медицинской науке занимала российская школа физиологов, которая связана с именами Ивана Михайловича Сеченова (18291905 гг.) и Ивана Петровича Павлова (18491936 гг.) практически ставшие основоположниками физиологии российской медицины. Особое значение работы Сеченова имело для развития физиологии нервной системы и нервно-мышечной физиологии: он первым выдвинул идею о рефлекторной основе психической деятельности и доказал, что «все акты сознательной и бессознательной жизни по способу происхождения суть рефлексы». Также Сеченов открыл центральное (сеченовское) торможение ещё в 1863 году, а его классический труд «Рефлексы головного мозга» (тоже от 1863 года) Иван Павлов назвал «гениальным взмахом русской научной мысли». Сам же Иван Павлов в отечественной науке, физиологии и медицине известен тем, что разделил всю совокупность физиологических рефлексов на условные и безусловные рефлексы, а также исследовал психофизиологию типов темперамента и свойства нервных систем, лежащие в основе поведенческих индивидуальных различий, являясь ещё основателем крупнейшей российской физиологической школы.
Большую известность имеет фамилия выдающегося учёного и врача России Николая Васильевича Склифосовского. Он являлся учёным-новатором, автором трудов по военно-полевой хирургии и хирургии брюшной полости. Был продолжателем отечественной хирургии, заложенной ещё Николаем Пироговым. Внёс существенный вклад в изучение, распространение и внедрение в отечественную хирургическую практику антисептического и асептического методов лечения, что помогло значительно снизить послеоперационную летальность в России! Являлся почётным членом Лондонского медицинского общества, Общества чешских врачей в Праге, Обществ врачей-хирургов в Париже и Будапеште, ряда вузов России, 20 различных обществ врачей России. В 18661867 годах работал в Германии в патологоанатомическом институте профессора Рудольфа Вирхова и в хирургической клинике профессора Бернгарда фон Лангенбека. Был даже в прусской армии, где работал на перевязочных пунктах и в военном лазарете. Затем работал во Франции у известных Кломарта и в клинике Нелатона, в Англии и Шотландии у Симпсона. После заграничной командировки вернулся в Одессу и был назначен заведующим хирургическим отделением городской больницы. В Одессе приобрёл репутацию талантливого хирурга, активно публиковался в научных журналах. Выпустил целую серию трудов10, благодаря которым в начале 1870 года по рекомендации самого Пирогова был приглашён на кафедру хирургии в Императорский Киевский университет. В 1871 году Склифосовский был переведён на кафедру хирургической патологии Императорской медико-хирургической академии, где он преподавал и оперировал. В этот период им напечатан ряд научных работ: «Резекция обеих челюстей»11, «Оперативное лечение неподвижности коленного сочленения»12, «Вырезывание зоба», «Сосочковое новообразование яичника (papilloma). Иссечение его» (1876) и др. В том же году работал в течение четырёх месяцев в военных лазаретах российского Красного Креста в Черногории, а затем на берегах Дуная. Николай Склифосовский принимал участие в нескольких военных кампаниях: австро-прусской войне (18661868) в составе действующей прусской армии в качестве полкового врача во время стажировки за границей, франко-прусской войне (18701871) в качестве врача-хирурга в военных госпиталях, сербско-черногорско-турецкой войне (1876) и русско-турецкой войне (18771878) военно-полевым хирургом, хирургом-консультантом госпиталей, ведущим хирургом Русской императорской армии. Профессиональный опыт, накопленный в четырёх кровопролитных войнах, позволило доктору медицины Склифосовскому существенным образом усовершенствовать способы и методы хирургического лечения огнестрельных ранений и переломов, оказало влияние на дальнейший рост его профессионального мастерства и искусства, авторитета в мировой науке! Он стал крупным военно-полевым хирургом своего времени, приумножив отечественную медицину новыми знаниями. Военно-полевая врачебная деятельность Склифосовского предоставила ему ценные материалы для опубликования ряда научных работ по военной медицине и военно-санитарному делу13: «Перевозка раненых на войне»14, «Наше госпитальное дело на войне»15, «В госпиталях и на перевязочных пунктах во время Турецкой войны» и другие труды.
С 1880 года Склифосовский начал работу в Московском университете в должности экстраординарного профессора кафедры факультетской хирургической клиники Московского университета, и именно он превратил университетскую клинику в одну из лучших в России, а потом и в Европе. Склифосовский внедрил антисептику: обязал врачей и всех присутствующих при операциях надевать чистые халаты, тщательно мыть и обеззараживать руки и медицинские инструменты, что позволило свести к минимуму осложнения после операции и заражения крови, распространённые в это время. Пример университетской клиники положительно сказался на внедрении антисептики и в других московских больницах, а потом это же распространилось на все остальные медучреждения страны и стала главной основой всего отечественного здравоохранения. Вообще считается что Пионерами антисептики в России были Н. И. Пирогов, Э. Бергманн, К. К. Рейер, но им не удалось в то время сделать антисептику достоянием всей отечественной медицины. В России, как и во многих других странах Европы, внедрение антисептики также встречало сильное сопротивление и критику со стороны медицинского сообщества. Но Николаю Склифосовскому, благодаря своему заработанному авторитету, удалось сломить это сопротивление сначала в Москве, а затем и во всей Российской империи. На I Всероссийском Пироговском съезде врачей в 1885 году он выступил с блестящей речью в защиту антисептического и асептического методов лечения ран, тем самым коренным образом изменил отечественную медицину! Ещё Склифосовский в 1879 году произвёл первую в России успешную (с благоприятным исходом) гастростомию на человеке прооперировал больного, страдающего раком пищевода. В 1883 году учёный стал одним из учредителей Русского хирургического общества (Пироговского общества), с 1883 по 1894 годы являлся его председателем.
С 1880 года Склифосовский начал работу в Московском университете в должности экстраординарного профессора кафедры факультетской хирургической клиники Московского университета, и именно он превратил университетскую клинику в одну из лучших в России, а потом и в Европе. Склифосовский внедрил антисептику: обязал врачей и всех присутствующих при операциях надевать чистые халаты, тщательно мыть и обеззараживать руки и медицинские инструменты, что позволило свести к минимуму осложнения после операции и заражения крови, распространённые в это время. Пример университетской клиники положительно сказался на внедрении антисептики и в других московских больницах, а потом это же распространилось на все остальные медучреждения страны и стала главной основой всего отечественного здравоохранения. Вообще считается что Пионерами антисептики в России были Н. И. Пирогов, Э. Бергманн, К. К. Рейер, но им не удалось в то время сделать антисептику достоянием всей отечественной медицины. В России, как и во многих других странах Европы, внедрение антисептики также встречало сильное сопротивление и критику со стороны медицинского сообщества. Но Николаю Склифосовскому, благодаря своему заработанному авторитету, удалось сломить это сопротивление сначала в Москве, а затем и во всей Российской империи. На I Всероссийском Пироговском съезде врачей в 1885 году он выступил с блестящей речью в защиту антисептического и асептического методов лечения ран, тем самым коренным образом изменил отечественную медицину! Ещё Склифосовский в 1879 году произвёл первую в России успешную (с благоприятным исходом) гастростомию на человеке прооперировал больного, страдающего раком пищевода. В 1883 году учёный стал одним из учредителей Русского хирургического общества (Пироговского общества), с 1883 по 1894 годы являлся его председателем.
Известен основоположник отечественной травматологии и нейрохирургии Ефрем Осипович Мухин (17661850). Ефрем Мухин родился 28 января (8 февраля) 1766 года в дворянской семье. Достигнув возраста в 1781 году поступил учился в Харьковский коллегиум. А в мае 1787 года уже назначается в Елисаветградский госпиталь для ухода за больными. В феврале 1789 года за положительную работу был переведён в главный госпиталь при главной квартире генерал-фельдмаршала князя Григория Потёмкина, где получил большую практику «не только в одном лазарете, но и на поле битвы», в том числе во время штурма Очакова. Так, Ефрем Мухин принимал участие в лечении наших солдат и офицеров в русско-турецкой войне, тем самым спас немало жизней. Именно в окопах под Очаковым рождался талант первого качественного лечения в области травматологии. По окончании Очаковского похода Мухин возвращается в Елисаветградский госпиталь, где с декабря 1789 года состоял подлекарем и прозектором анатомии. В январе 1791 года он был произведён в лекари и стал преподавать остеологию и «науку о вывихах и переломах» в медико-хирургической школе при госпитале, а также там же исполнял должность хирурга. Он также организовал в госпитале анатомический театр, где зачитывал врачам и студентам свои научные труды в области травматологии, труды которые легли в общую картину формирования в нашей стране отечественной травматологии! Сам Ефрем Мухин в своей жизни и работе проявлял характер патриотического человека, врачебного товарища, учителя, и был врачом, радеющим за развитие отечественной медицины и сам к этому лично прилагал усилия. Сочетая обширную практику с университетскими лекциями и руководством факультета, Мухин стремился поставить российские медицинские учреждения на европейский уровень. Он оказывал помощь многим талантливым, но бедным студентам, содержал на свои средства значительное количество врачей, готовившихся к профессуре и к практике в госпиталях. Вникая во все детали учебного процесса, Мухин создавал базу для развития медицинской науки на факультете: составил проект реорганизации медицинского факультета, переоборудовал анатомический театр, открыл специализированную медицинскую библиотеку, в которой студенты могли ознакомиться с новейшей (в том числе иностранной) литературой по медицине. Понимая необходимость учиться у европейских учёных, Мухин субсидировал молодых выпускников, выезжавших за границу. Стремясь привлечь больше слушателей на медицинский факультет, Мухин сам читал лекции на русском языке и требовал этого от других. Он же постоянно выступал против засилья профессоров-немцев на факультете, хотя «отнюдь не страдал ксенофобией», состоя членом Парижского, Гёттингенского и других научных обществ, и стремясь поддерживать «дарование и прилежание каждого студента и каждого врача, без всякого различия его нации и вероисповедания». Большое внимание Мухин уделял переводу на русский язык и переизданию дорогих и мало доступных латинских учебников. В 18131815 он сам написал первый учебник по анатомии на русском языке.