Вечером 27 декабря советские спецподразделения взяли штурмом резиденцию Х. Амина дворец Тадж-бек, операция продолжалась 40 минут, во время штурма премьер-министр был убит.
Ввод советских войск в Афганистан проходил по двум направлениям: Термез Хайратон Кабул и Кушка Герат Шинданд. С декабря 1979 по февраль 1980 г. части размещались по гарнизонам. В этот период войска серьёзных боевых действий не вели, за исключением небольших стычек с душманами и подавления антиправительственных выступлений.
В марте 1980 г. первой наступательной операцией стал рейд трёх батальонов в провинции Кунар. В мае была организована 2-я общевойсковая операция в провинции Кунар. Весной и осенью также проводились войсковые операции в Панджшерском ущелье. 3 августа в ходе выполнения боевой задачи подразделения 201-й мотострелковой дивизии попали в засаду и вели бой против многочисленного формирования моджахедов в Машхадском ущелье провинции Бадахшан. В ноябредекабре в провинциях Кабул, Парван и Бамиан проводилась масштабная операция «Удар-1».
В апреле 1981 г. проводилась 3-я Панджшерская операция. В июне в провинции Нангархар, в 85 км к югу от Джелалабада, в районе афгано-пакистанской границы, части советской 66-й мотострелковой бригады и афганской 11-й Джелалабадской пехотной дивизии взяли штурмом укрепрайон моджахедов Тора-Бора. В августе был разгромлен базовый район душманов в 30 км к югу от Мазари-Шариф в провинции Балх. В период августсентябрь снова проводилась боевая операция в Панджшерском ущелье. В декабре советские и афганские войска совместно разгромили базовый пункт оппозиции в ущелье Дарзаб, провинция Джаузджан.
В январефеврале 1982 г. проводились активные боевые действия в провинциях Кандагар, Парван, Каписа. Особенно тяжёлые бои развернулись в районе населённого пункта Джабаль-ус-Сирадж, провинция Парван, расположенного рядом с входом в Панджшерское ущелье. В апреле проводилась войсковая операция в провинции Нимроз. С мая по июнь проводилась крупномасштабная 5-я Панджшерская операция, в ходе которой впервые была осуществлена массовая высадка десанта в Афганистане: только в течение первых трёх дней было десантировано с вертолётов свыше 4 тысяч бойцов. Всего в этой операции принимало участие около 12 тысяч советских военнослужащих различных родов войск. Операция проходила одновременно на все 120 км в глубину ущелья. С августа проводилась уже 6-я Панджшерская операция: советские войска снова установили временный контроль над ущельем.
В марте 1983 г. проходила 2-я Мармольская операция. В апреле в провинции Нимроз советские войска захватили и уничтожили укрепрайон моджахедов Рабати-Джали, который одновременно служил крупной перевалочной базой производства наркотиков. Тогда же проходила общевойсковая операция по разгрому отрядов оппозиции в ущелье Ниджраб, провинция Каписа. В июле проходило массированное наступление моджахедов на Хост, попытка блокировать город не увенчалась успехом. С августа по январь 1984 г. отряды душманов осаждали советские войска в городе Ургун, провинция Пактика. Из-за использования моджахедами зенитной артиллерии и ПЗРК стало невозможно снабжение осаждённых по воздуху. На деблокаду города были брошены крупные силы советских и афганских правительственных войск.