Готовность Александра придать Тильзитскому союзу более прочные основания была связана и с началом новой русско-шведской войны. 1 февраля 1808 г. шведский король Густав IV ультимативно заявил русскому послу в Стокгольме о том, что примирение невозможно до тех пор, пока Россия удерживает Восточную Финляндию. Пытаясь опередить шведов Александр I приказал армии Буксгевдена перейти границы Швеции и нанести поражение разрозненным силам противника. 15 февраля начались первые стычки между русскими и шведскими войсками на территории Финляндии. Успех сопутствовал Буксгевдену после стремительного рейда казачьего отряда по льду Ботнического залива беспрепятственно был захвачен Гельсингфорс. 10 марта без боя сдался город Або, а 16 марта Александр I высочайшим манифестом объявил о присоединении Финляндии к Российской империи. Однако война затягивалась. Англия подписала с Швецией договор о ежемесячных субсидиях в 1 млн ф. ст. для борьбы с Россией и о своем участии в защите западной границы Швеции от французской угрозы.
Формирование англо-шведской коалиции значительно осложнило международной положение России. К тому же в борьбе на Балтике Россия не могла положиться на своего союзника Данию еще в августе 1807 г. английская эскадра совершила неожиданное нападение на Копенгаген и уничтожила датский флот. Значимость союза с Францией в сложившихся условиях необычайно возросла. Наполеон, в свою очередь, предпринял в январе 1808 г. последние попытки установить политический диалог с Англией. Ответом стало необычайно резкое выступление Георга III в парламенте с антифранцузской речью. На этом фоне новости, привезенные Савари из Петербурга, оказались очень своевременными. Новый французский посол в России А. Коленкур получил приказ начать переговоры о реальных перспективах тильзитского союза.
Переговоры Коленкура с министром иностранных дел Н. П. Румянцевым проходили в марте 1808 г. В ходе их быстро выяснилось, что интересы двух империй сталкиваются прежде всего в Восточном вопросе. В ходе острых дискуссий постепенно стали вырисовываться контуры предполагаемых сфер влияния России, Франции и Австрии на Балканах и в Малой Азии. Но камнем преткновения оказалась судьба Константинополя и Дарданелл. Самые изощренные доводы и аргументы не помогли дипломатам выйти из этого тупика становилось очевидным, что принцип «взаимосогласованной агрессивности» двух империй, положенный в основу тильзитского договора, ведет в их новому столкновению.
Александр I, очевидно, неплохо разбирался в природе возникших разногласий и не смущался фактическим срывом переговоров. Он считал, что личная встреча с Наполеоном, местом для которой был избран немецкий город Эрфурт, вполне может придать новый импульс союзу. В качестве своеобразного аванса указом Сената от 20 марта 1808 г. Александр наложил запрет на ввоз английских товаров в Россию. Однако реакция Наполеона оказалась неожиданной вместо подготовки новой конференции с российским монархом он покинул Париж и инкогнито отправился в Байону. Причиной тому стали тревожные известия из Испании.
Весной 1808 г. в Испании началось восстание. Прологом к нему послужило вторжение французского корпуса под командованием генерала Жюно в Португалию в ноябре 1807 г. Португальский королевский двор покинул страну и отправился в Бразилию. Но под фактическим контролем французских войск оказалась и Испания. Когда 19 марта в Аранхуэсе вспыхнул народный бунт, престарелый король Карл IV Бурбон поспешил отречься от престола в пользу сына. Наполеон не признал отречение и объявил испанский престол «вакантным». Все члены испанской королевской семьи были вывезены в Байону, а испанская корона досталась Жозефу Бонапарту (его неаполитанский престол занял И. Мюрат). Но кризис разрастался. Испания и Португалия оказались охвачены антифранцузским восстанием. В Португалии высадился английский экспедиционный корпус под командованием генерала Артура Уэлсли, будущего герцога Веллингтона. Жюно был разбит и военные действия переместились на территорию Испании.
Встреча Наполеона и Александра I в Эрфурте состоялась как раз в разгар испанских событий. К этому времени надежды русского императора на упрочение отношений с Францией сменились растущим недоверием к союзнику. Неприятное впечатление на Александра произвела и сама обстановка, царящая на конференции. В Эрфурт были приглашены многочисленные владетельные особы, признавшие сюзеренитет французского императора. Город захлестнула невиданная феерия роскошных приемов и военных парадов, балов и театральных представлений. Все это великолепие должно было, по замыслу Наполеона, продемонстрировать мощь и величие Французской империи. Но Александр был неприятно удивлен такой демонстрацией раболепия поверженной Европы. С удивлением Наполеон обнаружил в молодом императоре опытного, упорного, подозрительного противника. Это стоило ему тактического поражения в ходе переговоров. В тексте новой союзной конвенции (14 октября 1808 г.) вопросы, интересующие Россию утверждение ее границы по Дунаю, присоединение Финляндии, Молдавии и Валахии, снижение суммы прусской контрибуции были оговорены предельно четко, а вот совместные обязательства по борьбе с Англией и Австрией, столь важные для Наполеона, звучали в самой общей форме и сопровождались многими оговорками. Для обеспечения надлежащей прочности пошатнувшегося альянса Наполеон приготовил новый козырь проект своего брака с русской великой княжной (его брак с Жозефиной оказался бездетным, а для императора, собственными руками создавшего престол из обломков монархии, это было серьезной угрозой). Тайные переговоры с Александром по такому щекотливому вопросу Наполеон поручил Талейрану, не подозревая, что тот уже встал на путь предательства и начал использовать свои встречи с русским монархом для подрыва русско-французского союза. В итоге, Александр внешне вполне сочувственно отнесся к стремлению своего союзника породниться с русским императорским двором, но не дал никаких обещаний.
Эрфуртская конференция показала, что русско-французское сотрудничество так и не приобрело характер прочного союза. Однако оба императора охотно использовали даже формальные союзнические отношения для укрепления внешнеполитических позиций своих стран. Для России это развязывало руки в ведении войн со Швецией и Турцией. После первых успехов русской армии в Финляндии военные действия на этом направлении приобрели затяжной характер. Летом 1808 г. шведы при поддержке английского флота взяли под полный контроль Балтийское море, но уступили в нескольких сухопутных сражениях. С ноября по март обеими сторонами было заключено перемирие, а весной 1809 г. русская армия предприняла попытку внести перелом в ход кампании. Пройдя по льду Ботнического залива, русские отряды захватили Аландские острова и высадились на южном побережье Швеции. В это время в Стокгольме произошел государственный переворот. На престол взошел племянник Густава IV Карл XIII. Новый монарх поспешил заключить новое перемирие, но, когда русские войска вернулись в Финляндию, военные действия были возобновлены. В летние месяцы, вновь будучи отрезанной от морских коммуникаций, русская армия медленно развивала наступление в Центральной Финляндии. Шведы отвечали небольшими десантными операциями, но силы их были истощены. После скоротечных переговоров 17 сентября 1809 г. был заключен Фридрихсгамский мирный договор, в соответствии с которым Финляндия и Аландские острова отходили к России, а Швеция обязывалась расторгнуть союз с Англией и присоединиться к континентальной блокаде.
Весной 1809 г. начался и новый этап русско-турецкой войны. Еще в августе 1807 г. между Россией и Турцией при посредничестве Франции было подписано перемирие. Однако предусмотренный его условиями вывод русских войск из Молдавии и Валахии так и не состоялся. Провал петербургских переговоров о разделе Турции и результаты Эрфуртской конференции заставил Александра I активизировать усилия на этом театре военных действий. Начало кампании было неудачным. Русские войска понесли тяжелые потери при штурме крепости Браилов, а переправившись в июле через Дунай, втянулись в серию мелких стычек с противником. Лишь после назначения главнокомандующим князя П. И. Багратиона были предприняты решительные действия по захвату стратегически важных турецких крепостей. Однако угроза подхода основных сил турецкой армии во главе с великим визирем заставила Багратиона вновь отвести войска за Дунай. В кампании 1810 г. русской армией командовал генерал Н. М. Каменский. Наиболее упорные бои происходили в июле-августе у осажденной крепости Рущук. Несмотря на одержанную победу русской армии вновь не удалось завоевать стратегическое преимущество, и к зиме она вернулась в Валахию.
7 апреля 1811 г. командование Молдавской армией принял генерал М. И. Кутузов. К этому времени политическая обстановка в Европе существенно изменилась. Новое столкновение Россией с Францией становилось все более реальным. Перед Кутузовым была поставлена задача не только внести перелом в военные действия, но и вывести Россию из затянувшейся войны. Тем не менее, Кутузов отказался от тактики фронтального наступления и осады крепостей. Сконцентрировав свои силы между Рущуком и Бухарестом, он дождался подхода турецкой армии Ахмеда-паши и дал генеральное сражение 22 июне 1811 г. Турки понесли в нем большие потери, но вынудили русскую армию отступить и оставить Рущук. В конце сентября ударные силы турецкой армии переправились через Дунай. Но здесь они оказались заперты в ловушке обратный путь был закрыт кораблями Дунайской флотилии, а турецкий лагерь на правом берегу разгромлен русским десантом. 25 октября окруженная турецкая армия капитулировала. После длительных переговоров 16 мая 1812 г. был подписан Бухарестский мирный договор, по условиям которого русско-турецкая граница устанавливалась по реке Прут до соединения его с Дунаем, а затем по руслу Дуная до Черного моря. В составе России остались принявшие ее подданство народы Закавказья, но захваченные в Азии крепости возвращались Турции.
Все внимание Наполеона после завершения Эрфуртской конференции было сосредоточено на Испании. Для «второй кампании» осенью 1808 г. здесь было сосредоточено более 250 тыс. солдат. Общее командование на себя взял сам император. Французам противостояла 25-тысячная английская армия под командованием генерала Д. Мура и многочисленные, но разрозненные испанские войска. Французам очень досаждали нападения партизан они впервые оказались на войне, где, по словам Наполеона, «нет ни фронта, ни тыла». Впрочем, существенно изменить соотношение сил испанские партизаны, естественно, не могли. Активные военные действия начались в конце октября, и уже в ноябре Наполеону удалось нанести противнику несколько чувствительных поражений. Испанские армии были деморализованы, а англичане начали отступать в Португалию. 4 декабря был захвачен Мадрид, и на испанский престол вернулся Жером Бонапарт. Французы развернули фронтальное наступление и вынудили англичан эвакуироваться с Пиренейского полуострова в январе 1809 г. Однако решить «испанский вопрос» Наполеону так и не удалось. Уже в апреле 1809 г. в Португалии вновь высадилась английская армия под командированием А. Уэлсли и военные действия на Пиренейском острове затянулись еще на пять лет.