О существовании еще одного дневника стало известно только в 1940 году, когда после смерти еще одного выжившего члена экспедиции, матроса Александра Эдуардовича Конрада, его супруга передала рукопись в Музей Арктики и Антарктики. Объем дневника составляет 154 страницы. В отличие от литературного описания В. И. Альбанова дневник матроса Конрада содержит информацию от начала и до завершения экспедиции. В дневнике достаточно кратко зафиксированы координаты перехода шхуны, результаты охоты на морского зверя, рацион питания и короткие описания быта во время похода. В дневнике А. Э. Конрада зафиксирована оглашенная Г. Л. Брусиловым цель похода: «Пройти Карским морем и Ледовитым океаном во Владивосток, чтобы дорогою составить более подробную карту Ледовитого океана в границах азиатской России и также исследовать промыслы на тюленей, моржей и китов в области за мысом Челюскин».
В дневнике А. Э. Конрада описано само судно экспедиции: «Оно было построено лет сорок тому назад специально для плавания во льду, может так же хорошо идти под парусами, как и машиной Все судно построено из австрийского дуба с тремя обшивками».
Окончательный состав команды, отправившейся в Арктику, насчитывал 24 человека. Руководитель экспедиции Георгий Львович Брусилов, штурман Валериан Иванович Альбанов, исполняющая обязанности судового врача Ерминия Александровна Жданко (племянница начальника Главного Гидрографического управления с 1913 года М. Е. Жданко) и 21 человек экипажа.
Экспедиция отправилась в Арктику вокруг Европы от Николаевского моста в Санкт-Петербурге 28 июля 1912 года с запасом продовольствия только на одну зимовку, в то время как все предыдущие экспедиции на Новую Землю, организованные Главным гидрографическим управлением, брали запас на две зимовки.
2 (15) сентября в 8:30 утра шхуна достигла села Хабарово, расположенного на берегу пролива Югорский Шар, между островом Вайгач и материком южнее Новой Земли.
Пройдя через Югорский Шар в Карское море, «Святая Анна» встретила судно «Нимрод», капитан которого сообщил о тяжелой ледовой обстановке в море впервые за последние семь лет. Шхуна боролась со льдами в течение месяца, находясь недалеко от мыса Харасавэй и в октябре окончательно вмерзла в неподвижный припайный лед. В конце октября ледяное поле, в которое было вморожено судно, оторвалось от припая и стало медленно дрейфовать на север. Начался непрерывный дрейф судна в направлении Северного полюса.
1 ноября, согласно записям А. Э. Конрада, наступила полярная ночь. С наступлением зимы на шхуне стали отмечаться случаи заболеваний, предположительно цингой.
2 февраля (7 марта) 1913 года после определения широты и долготы (77° 17 с. ш., 78° 15 з. д.) в судовом журнале появляется запись: «мы вышли в Северный Ледовитый океан». В. И. Альбанов отмечает, что почти всю зиму Георгий Брусилов не выходил из своей каюты.
С приходом лета экипаж пытался вырваться из ледового плена, взрывая лед порохом до начала августа. 5 августа в дневнике А. Э. Конрада появилась запись: «Пришлось бросить всю эту работу, которая не сделала никакой пользы». Тяжелая обстановка на судне, вызванная безутешным положением, обострилась из-за накаленных отношений Брусилова с Альбановым. В результате 9 (22) сентября В. И. Альбанов был «отставлен от исполнения своих обязанностей штурмана».
10 августа начинается подготовка к новой зимовке, для чего шхуну пришлось существенно переустроить. При этом стали ощутимы проблемы с продовольствием и топливом.
В сентябре-ноябре «Святая Анна» продрейфовала по всему Карскому моря с юга на северо-запад. В ходе дрейфа Г. Л. Брусилов организовал метеорологические, гидрографические и гидрофизические наблюдения. Предположительно в ноябре 1913 года шхуна вышла в открытую часть Северного Ледовитого океана и была подхвачена трансарктическим переносом вод и льдов в направлении на северо-запад.
В начале декабря 1913 года «Святая Анна» прошла широту северных островов архипелага Земля Франца-Иосифа (ЗФИ). В. И. Альбанов, как опытный полярный штурман, понимая, что дальше уже не встретится никакой земли, просит Г. Л. Брусилова отпустить его по льдам к острову Рудольфа ЗФИ.
9 января 1914 года команда узнала, что штурман строит себе каяк для перехода по льдам к островам ЗФИ. Вместе со штурманом изъявили желание пойти еще 13 человек. Уход почти половины команды давал возможность остающейся экспедиции из 10 человек растянуть оставшийся запас продуктов еще на год, так как при подготовке экспедиции Г. Л. Брусилов предусматривал возможность только одной зимовки.
В. И. Альбанов предполагал добраться до мыса Флора в юго-западной части острова Западный Нортбрук, расположенного на юге ЗФИ, с которого стартовать на остров Шпицберген и далее на Новую Землю.
10 апреля группа из 14 человек покинула судно, на котором вместе с Г. Л. Брусиловым остались Е. Жданко, гарпунеры Шленский и Денисов, матросы Мельбард и Параприц, машинист Фрейберг, боцман Потапов, повар Калмыков. С этого момента о судьбе «Святой Анны» и оставшихся членов экипажа ничего не известно до сих пор.
Отряд Альбанова взял с собой семь каяков и семь нарт. В каяки были сложены провизия, палатка, малицы, кухня (переносная печка), два компаса, хронометр, бинокли Провизии взяли 590 кг, рассчитывая на два месяца пути. Большая часть провианта состояла из сухарей, так как предполагалось, что во время перехода будет вестись охота на морского зверя и белого медведя.
19 апреля трое участников санного похода Шабатура, Шахнин и Пономарев решили вернуться на «Святую Анну».
Самодельные нарты оказались крайне несовершенными для перехода по дрейфующим льдам. Под тяжестью провианта узкие полозья саней ломались. Груз перевозили в два захода, а иногда приходилось проделывать один и тот же путь трижды.
Первым пунктом перехода В. И. Альбанов назначил самый северный остров ЗФИ остров Рудольфа. Альбанов использовал в переходе зарисовку, сделанную еще Ф. Нансеном. С появлением солнца еще одной проблемой стала снежная слепота, об этом упоминается в обоих дневниках.
Потери в составе экспедиции начались 3 мая 1914 года, когда матрос Баев отправился на разведку более легкого пути во льдах, но обратно в лагерь так и не вернулся. В течение пяти дней осуществлялся его поиск, но безрезультатно. А. Э. Конрад пишет: «Нашли его след, который кончался у самой майны Предполагаем, что, может быть, он провалился и утонул».
15 мая во время переправы через полынью каяки стюарда Регальда, рулевого Максимова и Смиренникова перевернулись. Вместе с людьми и каяками погибли кухня и ружье. А. Э. Конрад пишет: «Сегодня пришлось ужинать сырым тюленьим мясом. С горем пополам растопили лед для питья».
С повышением температуры воздуха все труднее становилось передвигаться на нартах, поэтому чаще стали пользоваться каяками.
30 мая, определяя широту места по секстану, зафиксировали 82° с. ш. Скорость движения льдов в этом районе увеличилась, что указывало на отсутствие впереди какой-либо преграды, а именно суши. Движение льдов шло в юго-западном направлении. В. И. Альбанов записал: «Становится ясно, что нас проносит мимо этой земли». К этому времени в распоряжении путешественников осталось только три каяка, в них помещалась группа из 10 человек.