Они были хороши, даже слишком хороши, на самом деле, и вскоре покинули межведомственное соревнование LYR, присоединившись к местным ланкаширским лигам, взяв себе название пригорода северо-восточного Манчестера, в котором они и базировались: «Ньютон Хит (LYR)». Их успех продолжался. «Ньютон Хит» был непобедим в течение сезона 1882/83 годов, а в следующем сезоне впервые вышел в Кубок Ассоциации Ланкашира, обыграв «Хейдок Темперанс» со счетом 4:0 в своей первой игре. В 1885 году они вышли в финал Кубка Манчестера, в котором были обыграны «Херстом». За исключением восточного Ланкашира, в этом районе регби было предпочтительным зимним видом спорта Манчестер Гардиан продолжала отдавать ему приоритет до начала века но к 1880-м годам ситуация изменилась.
После того как в 1885 году был узаконен профессионализм, «Ньютон Хит» пригласил ряд талантливых игроков, многие из которых были из Уэльса, с предложением работы на железных дорогах. Они выходили в финал Синьор Кап каждый год до 1891 года, выигрывая соревнования четыре раза, но к тому времени их цели были гораздо выше. В 1886 году «Ньютон Хит» впервые выступил в Кубке Англии, сыграв вничью со счетом 2:2 против «Флитвуда». Полагая, что матч будет переигран, они ушли, в то время как судья настаивал на дополнительном времени; ФА присудила им поражение.
Осенью 1889 года «Ньютон Хит» присоединился к Футбольному Альянсу, сопернику Футбольной Лиги. Они заняли восьмое, а затем и девятое место из двенадцати команд в соревнованиях годом ранее, а в 1891/92 годах, вдохновленные правым вингером Альфом Фарманом, заняли второе место после «Ноттингем Форест». На следующий сезон было решено расширить Лигу, включив Альянс в качестве Второго дивизиона и увеличив размер Первого дивизиона с четырнадцати до шестнадцати команд. «Ньютон Хит» обнаружил, что их перевели в Первый дивизион, и ответил тем, что отбросил приставку «LYR» из своего названия, символически отбросив и свое железнодорожное происхождение.
Подъем «Ньютон Хит» был быстрым, но успех на поле скрывал, насколько трудными были дела вне его. Это был Манчестер в те времена, когда он был известен как Хлопкополис, «первый промышленный город в мире», как выразился Дэйв Хэслэм в своей культурной истории «Манчестер, Англия». Слегка замаскированный под Коктаун, в «Тяжелых временах» Диккенса он был грязным и бедным местом. Именно там, наблюдая огромную пропасть между владельцами и рабочими, Фридрих Энгельс в 1845 году написал «Положение английского рабочего класса в Англии». Там было богатство, но была также сильная бедность и ограниченные ресурсы для футбола. Клубы стояли на самом низком месте в списке приоритетов. «Ньютон Хит» играл в домашние игры на участке земли, арендованном у железной дороги, которая арендовала его у церкви, на Норт Роуд. Поверхность поля была далека от идеальной. «В некоторых местах, говорилось в описании в «Истории Футбольной Ассоциации Ланкашира», поле было твердым, как кремень, с пеплом под ним, который стал похож на железо, а в других густым от грязи». Почва имела высокое содержание глины, что означало, что там был плохой дренаж. Сначала игроки переодевались в пабе «Три короны» на Олдхэм Роуд, а затем в штаб-квартире клуба в отеле «Ширс», примерно в 800 метрах от поля.
Около 2 тыс. болельщиков не были редкостью, и в 1891 году местные сановники собрали средства на строительство трибуны, которая могла бы вместить 1 тыс. болельщиков. В письме Перси Янга, опубликованном в его истории клуба в 1960 году, преподобный Дж. Уилкоксон вспоминал атмосферу тех первых дней. «Матчи рекламировались в основном местными «командными листами», которые владельцы магазинов охотно размещали в своих витринах, писал он. Часто название команды соперника обозначалось как Другая, когда еще не определились с выбором противника. Зрители были ограждены от поля проволочным тросом, закрепленным на пнях высотой около метра, и Мэсси [Чарли и его брат Нэд, агрономы стадиона] обычно патрулировали вдоль и отгоняли мальчиков, которые забирались под ограждения, чтобы лучше видеть».
А. Х. Альберт, ранее работавший в «Астон Вилле», был назначен руководителем, став первым оплачиваемым официальным лицом клуба. Он арендовал коттедж под офис, а затем переехал в более просторный офис в заброшенной классной комнате в Майлз Платтинге, центральном районе города к востоку северо-востоку от центра, превратив его в социальный центр, где игроки и болельщики могли общаться и играть в бильярд.
А. Х. Альберт, ранее работавший в «Астон Вилле», был назначен руководителем, став первым оплачиваемым официальным лицом клуба. Он арендовал коттедж под офис, а затем переехал в более просторный офис в заброшенной классной комнате в Майлз Платтинге, центральном районе города к востоку северо-востоку от центра, превратив его в социальный центр, где игроки и болельщики могли общаться и играть в бильярд.
Первый сезон в высшем дивизионе был тяжелым. «Ньютон Хит» финишировал последним, выиграв лишь шесть из своих тридцати игр, что означало стыковой матч против команды, которая заняла первое место во Втором дивизионе, «Смолл Хит» (команда, которая затем стала «Бирмингем Сити»), чтобы определить повышения и понижения в классе. Ничья 1:1 в Бирмингеме привела к переигровке на Норт Роуд, которую «Ньютон Хит» выиграл со счетом 5:2.
Их форма не улучшилась в следующем сезоне, так как клуб был ввергнут в свой первый серьезный кризис. Площадка на Норт Роуд также использовалась для крикета, и LYR была обеспокоена тем, что футбольный клуб, к которому она больше не имела никакого отношения, повреждал поверхность для летней игры. В сентябре 1893 года «Ньютон Хит» переехал на Бэнк Лейн в Клейтоне, в пяти километрах оттуда. Поле осушалось лучше, чем на Норт Роуд, но, к несчастью, она располагалась с наветренной стороны тридцати труб соседнего химического завода, изрыгавшего едкий дым. Этот район был настолько печально известен, что местные придумали песню:
Летел Сатана над Клейтоном в ад,
Учуял по ветру он запаха смрад.
Сказал: «Не знаю, в какой я стране».
Но, судя по запаху, дом близок мне.
Толпа из 10 тыс. человек собралась на первую игру «Ньютон Хит» на их новом стадионе, победив «Бернли» со счетом 3:2, но это был сезон трудностей. Даже когда они побеждали, это приносило им мало почитателей. В следующем месяце они обыграли «Вест Бромвич Альбион» со счетом 4:1, что побудило журналиста Уильяма Джефкотта пожаловаться через Бирмингем Дэйли Газетт, что «это был не футбол, а просто жестокость». «Ньютон Хит» подал в суд, и, хотя они выиграли, им присудили только фартинг (четверть пенни) в качестве компенсации ущерба. Расходы были разделены, что еще больше напрягло их и без того скрипучие финансы. «Ньютон Хит» снова финишировал в нижней части таблицы, и на этот раз в плей-офф они были обыграны «Ливерпулем» со счетом 2:0.
Остальная часть десятилетия была постоянной борьбой, поскольку клуб продолжал терпеть неудачу с выходом в Первый дивизион. Игроки приходили и уходили, и хотя были некоторые пики полузащита, состоящая из Хью Моргана, Уильяма Моргана и Уолтера Картрайта, или как их называли «Старый триумвират», «Ньютон Хит» застрял во Втором дивизионе, их финансы ухудшались от сезона к сезону. Легенда гласит, что одно заседание совета директоров состоялось при свете трех свечей, вставленных в бутылки из-под имбирного пива после того, как корпорация отключила электричество. Когда Манчестер Ивнинг Ньюс, крупнейшая местная газета в регионе, построила лачугу на Бэнк Лейн, чтобы разместить телефон для своего репортера, они разрешили клубу использовать ее в качестве офиса. «Ньютон Хит» настолько обнищал, что стал выплачивать игрокам не установленную зарплату, а зарплату, пропорциональную проданным билетам.
К февралю 1901 года долг клуба составлял 2670 фунтов ст., и от их игры на поле было мало радости. «Ньютон Хит, писала Атлетик Ньюс после мрачной ничьей против «Гейнсборо Тринити», провел такой неудачный сезон, они так глубоко увязли в трясине, что, кажется, трудно позволить себе негативную критику, но после недавних игр особенно в Бернли было бы невозможно попытаться скрыть их многочисленные недостатки. Автору было бы приятно записать, что обещано нечто лучшее, но что можно сказать после последнего субботнего матча?»
Гарри Стаффорд, капитан клуба, привык принимать пожертвования от болельщиков со своей любимой собакой, сенбернаром по кличке Майор, который носил на шее жестянку для сбора пожертвований, в которой спасательные собаки могли бы носить бочку бренди, но он решил, что необходимы более решительные меры, и поэтому организовал базар под названием «Представительство Солнечных Земель» в Сент-Джеймс Холл на Оксфорд Роуд, полагая, что это может собрать до 1 тыс. фунтов ст. «Манчестер Сити» числился в числе покровителей. Там были военный оркестр и духовой оркестр «Бесс-о-тх-Барн», а также представления, демонстрирующие, как говорилось в программе, «мастерство Италии, Нила, Индии и Востока, Средиземноморья и Ривьеры».