COVID-19/SARS-CoV-2 - Александр Герасимович


COVID-19/SARS-CoV-2


Александр Герасимович

© Александр Герасимович, 2023


ISBN 978-5-0059-8873-7

Создано в интеллектуальной издательской системе Ridero

Посвящается всем медицинским работникам, отдавшим жизни в борьбе с COVID-19

АКРОНИМЫ

АГ  артериальная гипертензия

АИГА  аутоиммунная гемолитическая анемия

АЛТ  аланинаминотрансфераза

АПФ  ангиотензинпревращающий фермент

АСТ  аспартатаминотрансфераза

БАЛ  бронхоальвеолярный лаваж

ВДП  верхние дыхательные пути

ВОЗ  Всемирная организация здравоохранения

ВТЭ  венозная тромбоэмболия

ГГТ  гамма-глутамилтрансфераза

ГКС  глюкокортикостероиды

ДВС  диссеминированное внутрисосудистое свёртывание

ДН  дыхательная недостаточность

ЖКТ  желудочно-кишечный тракт

иАПФ  ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента

ИБС  ишемическая болезнь сердца

ИВЛ  искусственная вентиляция легких

ИМТ  индекс массы тела

ИПП  ингибиторы протонной помпы

ИТП  иммунная тромбоцитопения

КТ  компьютерная томография

мРНК  матричная рибонуклеиновая кислота

МФГ  мульти-функциональная группа

НДП  нижние дыхательные пути

НФГ  нефракционированный гепарин

ОАЭ  Объединенные Арабские Эмираты

ОИМ  острый инфаркт миокарда

ОРДС  острый респираторный дистресс-синдром

ПДКВ  положительное давление конца выдоха

ПНС  периферическая нервная система

ПЦР  полимеразная цепная реакция

РНК (RNA)  рибонуклеиновая кислота

САД  систолическое артериальное давление

СД  сахарный диабет

СИЗ  средства индивидуальной защиты

ТОРИ  тяжелая острая респираторная инфекция

ТЭЛА  тромбоэмболия легочной артерии

ФВ ЛЖ  фракция выброса левого желудочка

ФП  фибрилляция предсердий

ХБП  хроническая болезнь почек

ХОЗЛ  хроническое обструктивное заболевание легких

ЦНС  центральная нервная система

ЧД  частота дыхания

ЧСС  частота сердечных сокращений

ШКГ  шкала ком Глазго

ЭКМО  экстракорпоральная мембранная оксигенация


aOR  adjusted Odds Ratio

aPTT  activated partial thromboplastin time (активированное частичное тромбопластиновое время)

AB0  система групп крови

ACE2  аngiotensin-converting enzyme 2

ADCC  Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity

ADCP  antibody-dependent cellular phagocytosis

AIFA  Agenzia Italiana del Farmaco

AKI  acute kidney injury

ARB  angiotensin receptor blockers

ARDS  острый респираторный дистресс-синдром

ART  методы вспомогательной репродукции

ATI  acute tubular injury

BAL  бронхоальвеолярный лаваж

BCG  Bacillus Calmette-Guérin

Bi-PAP  bilevel positive airway pressure

BMJ  British Medical Journal

BSL3  Уровень биобезопасности 3

CAPA  легочный аспергиллез, связанный с COVID-19

CKD  chronic kidney disease

CLEIA  chemiluminescence enzyme immunoassay

COVID-19  COronaVIrus Disease 19

CPAP  постоянное положительное давление в дыхательных путях

CRISPR  clustered regularly interspaced short palindromic repeats

CRP  С-реактивный белок

CTD  C-terminal domain

CVD  cardiovascular disease

CVST  тромбоз церебрального венозного синуса

CXCL8  chemokine (C-X-C motif) ligand 8

CXR  рентгенограмма грудной клетки

DOAC  пероральные антикоагулянты прямого действия

DPI  средства индивидуальной защиты

ECMO  экстракорпоральная мембранная оксигенация

ELISA  enzyme-linked immunosorbent assay

EMA  Европейское агентство по лекарственным средствам

EMT  epithelial-mesenchymal transition

EUA  Разрешение на экстренное использование

EUL  Emergency use listing

FA  мерцательная аритмия

FDA  Food and Drug Administration

FFP  filtering facepiece

FiO2  фракционное содержание кислорода во вдыхаемом воздухе

GCS  шкала ком Glasgow

GDG  Guideline Development Group

GDS  Geriatric Depression Scale

GLP1  glucagon-like peptide 1

GOLD  Global Initiative for Obstructive Lung Disease

GSCF  Granulocyte-colony stimulating factor

HAT  human airway trypsinlike protease

HCoV  Human Coronavirus

HE  гемагглютининэстераза

HFNC  назальная канюля с высоким потоком

HFNO  назальный кислород с высокой скоростью потока

HIPA  тест на гепарин-индуцированную агрегацию тромбоцитов

HIT  гепарин-индуцированная тромбоцитопения

HIV  Human immunodeficiency virus

HR  hazard ratio

IBD  inflammatory bowel disease

ICU  отделение интенсивной терапии

IFN  интерферон

IFR  Infection Fatality Ratio

IgM  иммуноглобулин «M»

IL  интерлейкин

ILI  Immune-mediated liver injury

INR  international normalized ratio

INS  idiopathic nephrotic syndrome

IOIBD  International Organization for the Study of IBD

IP10  interferon-inducible protein

IPB  доброкачественная гиперплазия предстательной железы

ISPED  Italian Society for Pediatric Endocrinology and Diabetology

ISTH  International Society on Thrombosis and Haemostasis

IQR  межквартильный диапазон

JAKs  Janus kinase inhibitors

KL-6  KREBS Von Den Lungen-6

LDH  лактатдегидрогеназа

LFIA  lateral flow immunoassay

LUTS  lower urinary tract symptoms

mAb  моноклональное антитело

miR  micro-RNA

mRNA  матричная РНК

MAFLD  metabolic-associated fatty liver disease

MAIT  Mucosal-associated invariant T

MAP  среднее артериальное давление

MBL  mannose binding lectin

MCP1  Monocyte Chemoattractant Protein 1

MDA5  melanoma differentiation-associated gene 5

MDT  multidisciplinary team

MERS  Ближневосточный респираторный синдром

MEWS  Modified Early Warning Score

MFG  многофункциональная группа

MHPSS  mental health and psychosocial support

MIP1A  macrophage inflammatory protein-1 alpha

MIS-C  Multisystemic inflammatory syndrome in children and adolescents temporally related to COVID-19

MPV  mean platelet volume

MR-proADM  Mid-regional proadrenomedullin

MSC  мезенхимальные стволовые клетки

nsp  неструктурный белок

NAAT  Nucleic Acid Amplification Test

NAFLD  nonalcoholic fatty liver disease

NET  Neutrophil extracellular trap

NEWS2  National Early Warning Scores

NGS  next-generation sequencing

NICE  National Institute of Health and Clinical Excellence

NIV  non-invasive ventilation

NK  natural killer

NMDA  N-метил-D-аспартат

NPPV  Noninvasive Positive-Pressure Ventilation

NTD  N-terminal domain

NYHA  New York Heart Association

NXP2  nuclear matrix protein 2

OR  Odds Ratio

ORF  Open Reading Frame

PaO2  парциальное давление кислорода

PAPR  Powered Air Purifying Respirator

PASC  post-acute sequelae of COVID-19

PBW  predicted body weight

PDE5  phosphodiesterase type 5

PEEP  positive end-expiratory pressure

PEWS  Paediatric Early Warning Scores

PF4  Тромбоцитарный фактор 4

PICS  post-intensive care syndrome

PLR  Platelet‐to‐lymphocyte ratio

POC  Point-of-care

PPCI  primary percutaneous coronary intervention

PPI  proton pump inhibitor

PrEP  pre-exposure prophylaxis

PRES  posterior reversible encephalopathy syndrome

PSV  Pressure Support Ventilation

PT  протромбиновое время

PTSD  Post-traumatic stress disorder

PUFA  polyunsaturated fatty acids

PVR-SAE  potentially vaccine-related serious adverse event

PVS  post-VAC syndrome

RAAS  Renin-angiotensin aldosterone system

RBD  Receptor-binding domain

RCOG  Royal College of Obstetricians and Gynecologists

RCPCH  Royal College of Paediatrics and Child Health

RCT  рандомизированное контролируемое исследование

RdRp  RNA polimerasi RNA-dipendente

RDT  rapid diagnostic test

RDW  red blood cell distribution width

RNA  рибонуклеиновая кислота

ROX  взаимосвязь между насыщением кислородом, измеренным с помощью пульсоксиметрии/FiO2, и частотой дыхания

RPA/RAA  recombinase polymerase amplification/Recombinase-aided amplification

RT-PCR  полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией

SAGE  Strategic Advisory Group of Experts on Immunization

SAR  Secondary attack rate

SARI  тяжелая острая респираторная инфекция

SARS  Острое респираторное заболевание

SARS-CoV-2  Коронавирусный тяжелый острый респираторный синдром 2

SDGs  Sustainable Development Goals

SGLT2  Sodium-glucose Cotransporter-2

SGTF  S gene target failure

SIC  sepsis-induced coagulopathy

SIIA  Итальянское общество артериальной гипертензии

SIMG  Società Italiana di Medicina Generale e delle Cure primarie

SISET  Società Italiana per lo Studio dellEmostasi e della Trombosi

SOFA  Sequential Organ Failure Assessment

SpO2  насыщение крови кислородом

SSE  Superspreading events

STEMI  ST-Elevation Myocardial Infarction

TAPSE  Tricuspid annular plane systolic excursion

TGF-β  фактор роста опухоли бета

TGM/CGM  Tixagevimab/cilgavimab

TIMI  Thrombolysis in Myocardial Infarction

TLR2  toll-like 2 receptor

TMPRSS2  Transmembrane Serine Protease 2

TNF-α  фактор некроза опухоли альфа

TREM-1  Triggering receptor expressed on myeloid cells-1

UFH  нефракционированный гепарин

VATTS  Vaccine-associated Thrombosis and Thrombocytopaenic Syndrome

VE  Vaccine effectiveness

VITT  vaccine-induced immune thrombotic thrombocytopenia

VKA  vitamin K antagonists

VOC  variant of concern

VOI  variant of interest

VTE  венозная тромбоэмболия

VUI  variant under investigation

VZV  varicella zoster virus

+ssRNA  Positive-Sense Single-Stranded RNA

ВВЕДЕНИЕ

В этой книге я постараюсь рассказать вам все то, что известно о коронавирусе SARS-CoV-2 на февраль 2023 года. Я буду исходить из принципов доказательной медицины. В книге, одной из первых в своем роде, предоставляются более полные и обновленные данные о свойствах вируса, его происхождении, эпидемиологии. Я также расскажу о патофизиологии, клинических данных, осложнениях, диагностике, лечении и прогнозе COVID-19, long COVID, профилактике, вакцинации против SARS-CoV-2, гигиенических процедурах и правильном использование средств индивидуальной защиты, влиянии COVID-19 и вакцин на сексуальное и репродуктивное здоровье, влиянии инфекции SARS-CoV-2 на беременных матерей, а также на плод и новорожденного. Рекомендации по лечению и диагностике основаны на документации ВОЗ, SISET, ISTH, AIFA, NIH, SIMG, RCPCH, RCOG, NICE, SIIA, ISPED, GOLD. Это полное и синтетическое клиническое руководство, которое будет полезно студентам медицинских ВУЗов, аспирантам, преподавателям, педиатрам, гинекологам, сотрудникам отделений, занимающихся лечением больных COVID-19 и всем, кто интересуется этой темой, поскольку включает в себя исчерпывающую библиографию.

Для сбора данных был проведен поиск в PubMed систематических обзоров и метаанализов по ключевым словам «covid19 pathology», «covid-19», «SARS-CoV-2» с 2020 по 2023 год. Последний поиск в базе данных PubMed с ключевым словом «SARS-CoV-2» был выполнен 02.02.23. Помимо самых последних метаанализов и систематических обзоров, были проанализированы несколько отдельных исследований, опубликованных с начала пандемии до сентября 2021 г. Было изучено более 12 000 систематических обзоров и метаанализов, а также несколько отдельных РКИ. Не все исследования были процитированы в этой работе. Однако, это не означает менее важной роли других опубликованных статей. Пищевые добавки/витамины, фитотерапия, пробиотики или традиционная китайская медицина/аюрведическая медицина в качестве возможной терапии COVID-19 не рассматриваются в этой книге.

Интерпретация данных: необходимо учитывать риск bias; кроме того, многие исследования о COVID были ретроспективными или обсервационными. Кроме того, одно исследование (A Capodici, 2022) предполагает, что было обнаружено двадцать семь отозванных статей о COVID. Многие статьи, опубликованные в течение первого года пандемии, были отозваны, в основном из-за научных нарушений со стороны авторов. Дублирование, плагиат, мошенничество и отсутствие согласия были основными причинами отзыва. Кроме того, Yanfei Li, 2021, отмечает, что среди 243 проверенных систематических обзоров с точки зрения методологического качества исследований 12,3% были среднего качества, 25,9%  низкого качества и 61,7%  критического качества. [683] Было показано, что такие факторы, как предвзятость дизайна исследования в текущей литературе, дублирование отчетов, различные критерии включения в систематические обзоры, недостаточность данных, неадекватный период наблюдения и ограничения систематических обзоров, препятствуют возможности точной экстраполяции данных. (X L Ang, 2021) I. Skafle et al., 2022, определили 3 основные темы дезинформации в контексте пандемии: медицинская дезинформация, разработка вакцин и заговоры. Дезинформация, распространяемая в социальных сетях, оказала негативное влияние на недоверие к вакцинам и их принятие; одно исследование содержало дезинформацию об аутизме как о побочном эффекте вакцин против SARS-CoV-2.

S Zhao, 2023, предполагает, что дезинформация о вакцинах включала заговоры, опасения по поводу безопасности и эффективности вакцин, бесполезность вакцин, мораль и прочее. Вопросы заговора и безопасности были самой распространенной дезинформацией. Распространенность дезинформации сильно различалась: от 2,5% до 55,4% среди населения в целом.

Однако это, конечно, не означает, что все, что мы знаем о вирусе до сих пор, бесполезно. Эти данные говорят нам о том, что исследования нужно совершенствовать, нужно искать ответы, которые еще не даны на некоторые вопросы о COVID-19. Кроме того, организации здравоохранения должны подготовить свои ответы на следующие этапы инфодемии COVID-19 и будущей инфодемии в целом.

Целью этой книги было, прежде всего, собрать всю важную, основанную на доказательствах, доступную информацию о вирусе SARS-CoV-2 и заболевании COVID-19, стимулировать исследования (прежде всего, качественные исследования, без плагиата и/или мошенничества), найти ответы на различные вопросы. Ожидается, что после публикации можно будет выявить другую информацию особой важности, исправить неверные/неполные данные. Кроме того, эта книга может быть полезна для управления здравоохранением и экономикой при подобных пандемиях в будущем, которые весьма вероятны в эпоху глобализации.


А. Герасимович


Все данные были пересмотрены и интегрированы в феврале 2023 года.

Об авторе. Врач-терапевт, выпускник ДГМА 2016 года. В 2018 году закончил интернатуру в городе Днепр («Внутренняя медицина»). В 20122013 гг.  практика в Италии (отделения ортопедии и внутренней медицины). В июле 2021 г.  успешное подтверждение украинского диплома в Università degli Studi di Perugia в Италии. Автор книг «Коронавирус и артериальная гипертензия», «Профилактика коронавирусной инфекции»; соавтор книг «Коронавирус и беременность», «Страна 38-UA или украинская аномалия» и др. В 2020 г. получил сертификаты ВОЗ «Клиническое Ведение ТОРИ», «Профилактика и контроль новой коронавирусной инфекции (COVID-19)». В ноябре 2020 года прослушал многочасовой семинар по COVID-19 в Италии: «Condividiamo? Coronavirus, non solo una sfida clinica» с участием микробиологов, инфекциониста, эпидемиолога, клиницистов, анестезиолога и экономиста. В ноябре-декабре 2020 года  волонтерство в Департаменте гигиены и профилактики города Перуджа (проект «Contact tracing COVID-19») во время всплеска заболеваемости COVID-19 в регионе Умбрия. В мае 2021 года  участие в семинаре «Применение вакцин от COVID-19: разъяснения о редких тромбозах при применении вакцины AstraZeneca» в Италии. Посетил более 30 конференций, среди которых: XXIV Всеукраинский съезд кардиохирургов, VI Научная сессия ГУ «ИГ НАМН У», Украинский симпозиум «PainControl» и др.

Дальше