Также одним из инициаторов возрождения ГЭСЛО стал один из открывателей Северной Земли в составе предыдущей ГЭСЛО в 1913 г. Неупокоев Константин Константинович, находящийся в момент составления доклада в Архангельске в составе Флотилии Северного Ледовитого океана.
3 апреля 1918 года начальник ГГУ направил письмо (исх. 1262) начальнику ГОСЛО, в котором указывалось, что согласно положительной резолюции Коллегии по морским делам на доклад ГГУ от 26.03.1918 «предлагается приступить к комплектованию» Отряда. На основании этого письма начальник ГОСЛО Максимов Г. С. 9 апреля издал приказ 12 о приеме на работу командира судна «Пахтусов» Василия Падорина (последний приказ по ГОСЛО, найденный в РГА ВМФ, датируется 17 августа 1918 года за номером 40).
15 (нов. ст.) апреля 1918 г. Приказом начальника ГГУ 171 начальником экспедиции Западно-Сибирского района Северного Ледовитого океана (ГЭ ЗСР СЛО) был назначен военный моряк флота (военмор) Б. А. Вилькицкий. В составе Гидрографической экспедиции Западно-Сибирского района Северного Ледовитого океана (ГЭ ЗСР СЛО) должно было работать три отряда: Карского моря (начальник Д. П. Руденский), Самоедского берега и Новой Земли, и Обь-Енисейский (позже его возглавил Неупокоев К. К.).
В тот же день, 15 апреля, был подписан и приказ 172 о назначении начальником Гидрографической экспедиции Восточно Сибирского района СЛО (ГЭ ВСР СЛО) военмора П. А. Новопашенного (РГА ВМФ, фонд Р 180, опись 1, дело 4).
Необходимо отметить, что данные назначения были утверждены приказом народного комиссара по морским делам Л. Д. Троцкого 454 только 24 июня 1918 года. Еще более удивительным выглядит предварительное назначение комиссаром Гидрографической экспедиции Западно Сибирского района СЛО матроса телеграфиста Максима Шунько (приказ Наркома Л. Д. Троцкого 433 от 15 июня 1918 года), участника ГЭСЛО в 19131915 гг., о назначении которого скрытно ходатайствовал сам Б. А. Вилькицкий, о чем упоминал в своей книге «Когда, как и кому я служил под большевиками. Воспоминания белогвардейского контр-адмирала», написанной им в Брюсселе в 1942 г., но изданной только после его смерти в 1974 году в Париже (сейчас это издание доступно в Интернете).
В ходе работы в архиве ВМФ был найден приказ Л. Д. Троцкого 453 также от 24 июня 1918 года о назначении начальником Управления по обеспечению безопасности кораблевождения на Белом и Баренцевом морях военмора гидрографа геодезиста Н. Н. Матусевича, исполняющего также обязанности начальника Гидрографической экспедиции Белого моря. Штат Убеко Север был утвержден в количестве 32 человек (6 августа 1918 года Н. Н. Матусевич на бланке Убеко Север еще писал письмо в ГГУ по делам Управления). Таким образом, можно констатировать, что существующее представление о том, что УБЕКО Север было создано только в 1920 году не соответствует истине.
2 мая 1918 года из ГГУ было направлено письмо (исх. ном. 1678) в Народный комиссариат по морским делам о потребности судов для организации гидрографических работ на Севере из состава Флотилии СЛО и Балтийского флота. В письме упоминаются 6 подразделений ГГУ на Севере: Дирекция маяков и лоций Белого моря, Гидрографическая экспедиция Белого моря (для нее из состава Флотилии СЛО предлагалось передать суда «Овцын», «Мурман» и тральщики 1, 2, 4 и 8), ГОСЛО (в скобках, видимо, для напоминания указано: «Мурманский», для него из состава Флотилии СЛО предлагалось передать суда «Пахтусов» и «Колгуев), ГЭ ЗСР СЛО (для нее из состава Флотилии СЛО предлагалось передать суда «Таймыр», «Вайгач», «Купава» и три моторных катера), ГЭ ВСР СЛО (для нее из состава Флотилии СЛО предлагалось передать судно «Иней»), а также Обско Енисейская партия ГЭ ЗСР СЛО (для нее предлагалось передать несколько судов с Балтийского флота).
11 мая 1918 года из ГГУ было направлено письмо в Коллегию по Управлению воздушным флотом (исх. ном. 52), в котором просило содействия в выделении гидропланов для двух планируемых аэростанций в Карском море для обеспечения безопасности плавания, проведения ледовой разведки и содействия развитию промыслов. Таким образом, можно констатировать, что руководство ГГУ подходило к развитию гидрографических работ на Севере с размахом и современным подходом.
30 мая 1918 года после получения положительного заключения на письмо в Коллегию по Управлению воздушным флотом о выделении Экспедиции «воздушных кораблей типа «Илья Муромец» Б. А. Вилькицкий пишет письмо в ГГУ (исх. ном. 231) «о сформировании при Экспедиции специального отряда этих Кораблей». Для реализации этого Б. А. Вилькицкий просит Управление ускорить выделение ассигнований.
На основании данного письма, затем было подготовлено письмо от начальника ГЭ ЗСР СЛО Б. А. Вилькицкого в Морской Генеральный штаб с просьбой о выдаче распоряжения фирме «Братьев Нобель» об отпуске с их складов двух тысяч пудов бензина и двух тысяч пудов керосина для нужд авиационных отрядов Экспедиции СЛО морскому летчику Бересневичу Л. А. (выпускник Морского кадетского корпуса 2 мая 1914 года).
6 июня 1918 года Б. А. Вилькицкий выступил на 3-м делегатском съезде моряков Флотилии СЛО с докладом о необходимости подготовки экспедиции к устьям сибирских рек. В нём он подчеркнул необходимость посылки экспедиции как для изучения условий плавания и установки навигационного оборудования (с тем, чтобы северным путём можно было завозить и хлебные запасы), так и с целью замены зимовщиков на немногочисленных на тот момент времени полярных радиостанциях. Съезд эти предложения полностью поддержал, благодаря чему в распоряжение Б. А. Вилькицкого впоследствии были выделены легендарные транспорты предыдущего ГЭСЛО «Таймыр» и «Вайгач», посыльное судно «Бакан» и ряд других (Протокол п. 5 от 6.06.1918, РГА ВМФ, ф. р-19, on. 1, д. 24, л. 1114).
1 июля 1918 года начальник ГГУ направил письмо начальнику ГЭ ЗСР СЛО (исх. ном. 725) о том, что согласно приказу 403 Коллеги Наркомата по морским делам, должности военных гидрографов приравнены к морякам военного флота.
2 июля 1918 г. Совет народных комиссаров (Совнарком) Республики принял постановление, подписанное В. И. Лениным, об отпуске одного миллиона рублей на снаряжение Гидрографической экспедиции Западно-Сибирского района СЛО с последующим утверждением этой суммы Комиссией Совнаркома на следующий день 3.07.1918.
Гидрографическая экспедиция Восточно-Сибирского района (ГЭ ВСР) СЛО ввиду удаленности района работ комплектовалась очень медленно. В РГА ВМФ в фонде Р 898, опись 1 найдена переписка Б. А. Вилькицкого с каким-то ученым по имени Лев Леонидович, в которой указано, что на вопрос о состоянии ГЭ ВСР Борис Андреевич рекомендует обратиться к начальнику данной экспедиции П. А. Новопашенному, располагающемуся по адресу: Петроград, Крюков канал, д. 6.
В Интернете найдены сведения, что в начале 1919 года П. А. Новопашенный был главным редактором журнала «Морской сборник», в июле того же года убыл из Петрограда и перешел в армию Юденича.
В начале июля 1918 года Б. А. Вилькицкий с группой офицеров, которым роздал для провоза 800 000 рублей из выделенного миллиона на экспедицию, прибыл в Архангельск. Личный состав экспедиции разместился на транспортах «Вайгач» и «Таймыр». 24 июля Б. А. Вилькицкий на бланке ГЭ ЗСР СЛО отправил письмо командирам транспортов «Вайгач» (военмор А. И. Клисс, экипаж 41 человек) и «Таймыр» (военмор П. В. Тихменев, экипаж 50 человек) о необходимости подготовки их к выходу к 1 августа. К моменту выхода в море в экспедиции состояло 22 человека административного состава и 103 человека команды.
Однако 2 августа 1918 года в Архангельске произошел антибольшевистский переворот и весь состав ГЭ ЗСР СЛО перешли на сторону Правительства Верховного управления Северной области (данное Правительство 16 октября 1919 году произвело Б. А. Вилькицкого в чин контр-адмирала).
16 августа 1918 г. суда «Таймыр» и «Вайгач» под руководством Б. А. Вилькицкого убыли из Архангельска для проведения экспедиции в устье реки Енисей. Предполагалось: построить радиостанцию в селе Дудинка, снабдить припасами радиостанцию на острове Диксон и заменить ее персонал. К сожалению, во время похода 8 сентября погибло судно «Вайгач», выскочившее в тумане на банку у мыса Ефремов Камень в Енисейском заливе (обнаружено на дне гидрографами Северного флота, включая специалистов Нашей экспедиции, в 2020 г., а подтверждено документально летом 2021 г.). Доставив продовольствие на полярные станции и приняв на борт некоторое количество продовольствия в устье Енисея, ГЭСЛО вернулась в Архангельск в октябре.
18 августа 1918 года Коллегия по морским делам направило в ГГУ письмо об оставлении при Управлении в Петрограде гидрографа геодезиста Матусевича Н. Н., начальника Убеко Север и Гидрографической экспедиции (ГЭ) Белого моря, в связи с тем, что выполнение заданий экспедициями в настоящее время не осуществимы. Тем не менее, 31 августа начальник ГГУ направил письмо в Убеко Север (исх. ном. 3272) о том, что Котельников Д. Ф. Врид начальника ГЭ Белого моря назначается в Управление на должность начальника партии. В октябре в ГГУ еще поступали письма от Убеко Север, в частности, 28 октября.
30 августа 1918 года от члена Коллегии Наркомата по морским делам С. Е. Сакса в ГГУ пришло предписание (исх. ном. 673) о том, что в связи с началом Гражданской войны и интервенцией Антанты на границах России, немедленно начать расформирование всех экспедиций Управления. В предписании указывалось: «1. Имущество сдать на склады порта. 2. Продукты сдать в Продсклад. 3. Суммы отпущенные сдать в Казначейство. 4. Личный состав расформировать». Данное указание было разослано ГГУ в Убеко Север, ГЭ ЗСР СЛО и ГЭ ВСР СЛО.
Обращает на себя внимание то, что предписание С. Е. Сакса не было разослано в ГОСЛО. С учетом того, что последний найденный в РГА ВМФ приказ начальника ГОСЛО 40 датируется 17 августа, то можно предположить, что ГОСЛО к 30 августа было либо ликвидировано, либо включено в ГЭ Белого моря. Сам начальник ГОСЛО в августе 1918 года был назначен начальником Дирекции гидрографии и штурманского дела Убекобалта. Также в архиве РГА ВМФ Р-898 найдена запись, что судно «Лейтенант Пахтусов», ранее принадлежавший Отдельной съемке Мурманского берега, а затем ГОСЛО, было включено в состав ГЭ БМ 18 апреля 1920 года, но 22 июня 1920 года было передано в ГЭСЛО, которое стало так называться вместо ГЭ ЗСР СЛО.
На основании предписания С. Е. Сакса, начальник ГГУ 5 сентября отправил данное указание в ГЭ ЗСР СЛО (исх. ном. 3352), 10 сентября в ГЭ ВСР СЛО (исх. ном. 3415), а 20 сентября в Убеко Север (исх. ном 3659). При этом в своих письмах ГГУ, несмотря на фразу С. Е. Сакса: «немедленно расформировать», указывало: «3. Приступить к расформированию личного состава. Последнее произвести с таким расчетом, чтобы не нарушить научных работ по подготовке экспедиций. Вместе с тем представить мне списки всего личного состава с указанием кого необходимо оставить в первую очередь». Таким образом можно констатировать, что руководство ГГУ саботировало предписание о немедленном роспуске всех Экспедиций Управления.
9 сентября 1918 года заместитель начальника ГЭ ЗСР СЛО начальник отряда военмор Юркевич К. отправил в ГГУ письмо на бланке экспедиции (исх. ном. 941) о том, что после беседы с С. Е. Саксом было принято решение об оставлении в экспедиции 30 человек вместо 192 человек на 01.09.1918.
14 сентября 1918 года начальник ГЭ ВСР СЛО военмор П. А. Новопашенный направил письмо в ГГУ (исх. ном. 565), в котором представил списки личного состава в трех категориях. Первая группа: необходимые к оставлению 12 человек, вторая группа: желательна к оставлению 5 человек и третья группа: не необходимая 18 человек. 20 сентября из ГГУ пришел ответ, что необходимо уволить «тотчас» конкретных офицеров из группы 1, двоих офицеров из группы 2 и всех перечисленных в группе 3. Таким образом в экспедиции было оставлено 12 человек.
21 сентября 1918 года начальник ГГУ направил письмо в Коллегию Наркомата по морским делам (исх. 3683), в котором докладывал, что приступил к расформированию экспедиций, а для остающегося личного состава в них имеющихся ассигнований достаточно. 11 октября 1918 года Коллегия Наркомата утвердила решение ГГУ, при этом указала, что оставшиеся от 1 млн рублей 200 000 рублей для ГЭ ЗСР СЛО не выдавать, так как к тому моменту времени было известно, что данная экспедиция перешла на сторону Белого движения.
Только 11 августа 1919 года Коллегия Наркомата по морским делам своим письмом (исх. ном. 244) уведомила ГГУ, что утвердила списки оставленных в Убеко Север, ГЭ ВСР и ГЭ ЗСР. В архивах РГА ВМФ была найдена также переписка начальника ГЭ Белого моря Н. Н. Матусевича о том, что в экспедиции достаточно ранее назначенных ассигнований и поэтому дополнительных средств не требуется. Видимо поэтому это подразделения ГГУ и не было включено в список на сокращение.
Перейдя на сторону правительства Северной области, Б. А. Вилькицкий активно вел переписку с различными организациями, перешедшими на сторону Белого движения и в том числе с Правительством А. В. Колчака в Омске. Все письма исполнялись на бланке ГЭ ЗСР СЛО с указанием в подписи воинского звания «капитан 1 ранга».
На 20 мая 1919 года в экспедиции в административном составе числилось 8 человек: начальник экспедиции, начальник Отряда Карского моря, 4 начальника Отдельных партий, среди которых начальник Отдельной партии промера «Б» старший лейтенант Неупокоев К. К., и 2 начальника партии.
27 мая 1919 года штат административного состава ГЭ ЗСР СЛО составлял 85 человек, а команды 213 человек.
3 июня 1919 года генерал губернатор Северной области утвердил новый штат экспедиции: административный состав 104 человека (включая таковой персонал на судах), а команды 184 человека.
В делах фонда нашлась переписка от 15 июня 1919 года, что для комплектации команды экспедиции привлекались добровольцы бывшие военнослужащие, прибывшие из германского плена.
В августе 1919 года Б. А. Вилькицкий, кроме отряда гидрографических судов ГЭ ЗСР СЛО, возглавил очередную экспедицию общим числом уже из 19 судов для похода через Карское море к устью реки Енисей и обратно для доставки продовольствия в голодающую Архангельскую губернию. В октябре большинство судов вернулось в Архангельск с продовольствием. Старший лейтенант К. К. Неупокоев в ходе этого похода командовал отрядом из пяти гидрографических судов: «Иней», «Орлик», «Шуя», «Полезный» и «Анна», которые остались в Омске и вошли в состав Отдельного гидрографического Обь-Енисейского отряда, который он возглавил с 27 июля в соответствие с приказом по ГЭСЛО 216, утвержденный приказом командующего Флотилией СЛО 875 от 19.08.1919. За успешное проведение операции по переходу судов к острову Диксон Б. А. Вилькицкий 5 сентября обратился к Морскому министру правительства А. В. Колчака в Омске по производству Неупокоева К. К. в капитаны 2 ранга и представлению к награде.
11 августа 1919 года Информационное отделение ГГУ в Москве представило в ГГУ в Петрограде (исх. ном. 244) согласованные списки Управляющим морским комиссариатом (Упморком) личного состава Убеко Север, ГЭ ЗСР СЛО и ГЭ ВСР СЛО. Примечательно, что от лица ГЭ ВСР СЛО первоначальную информацию от 18 июля представил начальник Ленско Колымского отряда Коптев (инициалы, к сожалению, в документе не указаны, а в Интернете их также найти не удалось), что можно свидетельствовать, что к этому моменту начальник ГЭ ВСР СЛО Новопашенный П. А. покинул свою должность, перейдя в июле в армию генерала Юденича.